More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3955 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  100 
 
 		 412 aa  819    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  77.07 
 
 		 410 aa  630  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  66.18 
 
 		 440 aa  551  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  68.18 
 
 		 420 aa  545  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  66 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0781  amidohydrolase  60.21 
 
 		 418 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  58.59 
 
 		 391 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5928  amidohydrolase  56.12 
 
 		 417 aa  421  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  57.47 
 
 		 415 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  56.62 
 
 		 480 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0694  peptidase M20D, amidohydrolase  54.97 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  55.84 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6414  amidohydrolase  55.61 
 
 		 423 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.820069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  55.53 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  55.83 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  52.12 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  50.76 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2948  amidohydrolase  54.47 
 
 		 415 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0823  amidohydrolase  51.15 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1019  amidohydrolase  52.94 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.533983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1133  amidohydrolase  51.59 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  52.37 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1358  amidohydrolase  51.79 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.624162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0993  amidohydrolase  51.43 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.491415  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1612  amidohydrolase  52.12 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05720  amidohydrolase  54.57 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21290  amidohydrolase  51.6 
 
 		 413 aa  358  7e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0986  amidohydrolase  48.85 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1246  peptidase M20D, amidohydrolase  52.65 
 
 		 390 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1273  amidohydrolase  52.38 
 
 		 390 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1263  amidohydrolase  52.65 
 
 		 390 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.413337 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04870  amidohydrolase  48.59 
 
 		 418 aa  350  4e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.946218  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4826  amidohydrolase  52.65 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13334  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase amiA1  52.51 
 
 		 389 aa  345  7e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  37.24 
 
 		 380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  41.18 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  37.5 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  37.5 
 
 		 394 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  40.82 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  41.99 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  41.14 
 
 		 395 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  39.09 
 
 		 393 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  37.89 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  38.31 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  39.95 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  38.31 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  35.62 
 
 		 386 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  39.79 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  36.6 
 
 		 394 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  38.32 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  37.11 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  38.62 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  35.48 
 
 		 394 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  39.52 
 
 		 392 aa  245  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  39.95 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  33.86 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  38.92 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  38.34 
 
 		 405 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.62 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  38.96 
 
 		 396 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  36.2 
 
 		 415 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  39.1 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.38 
 
 		 381 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  38.99 
 
 		 400 aa  240  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  38.9 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  35.31 
 
 		 381 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  35.28 
 
 		 392 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  35.29 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  38.3 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  37.37 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.27 
 
 		 400 aa  237  4e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  35.05 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  36.32 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  36.02 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1761  amidohydrolase  33.69 
 
 		 394 aa  235  8e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  36.64 
 
 		 398 aa  235  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  37.99 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  35.7 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  36.36 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  38.59 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  36.13 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  41.53 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  34.62 
 
 		 381 aa  233  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  39.29 
 
 		 391 aa  233  7.000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  34.32 
 
 		 388 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  37.6 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  38.07 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  36.25 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  33.51 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  37.06 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  36.79 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  36.68 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  37.53 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  35.7 
 
 		 386 aa  229  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  35.7 
 
 		 385 aa  229  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1918  amidohydrolase family protein  34.6 
 
 		 372 aa  229  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  35.86 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  39.55 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  36.29 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  37.15 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>