More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1358 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1358  amidohydrolase  100 
 
 
395 aa  778    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.624162  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6414  amidohydrolase  60.31 
 
 
423 aa  458  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.820069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05720  amidohydrolase  57.14 
 
 
426 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  52.14 
 
 
392 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1612  amidohydrolase  51.84 
 
 
391 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0803782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  51.79 
 
 
412 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  50.92 
 
 
415 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  50.13 
 
 
391 aa  368  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  51.99 
 
 
410 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  49.75 
 
 
440 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2948  amidohydrolase  49.74 
 
 
415 aa  359  6e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  48.83 
 
 
420 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1246  peptidase M20D, amidohydrolase  52.93 
 
 
390 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1263  amidohydrolase  52.93 
 
 
390 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.413337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  48.45 
 
 
412 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1273  amidohydrolase  52.93 
 
 
390 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0986  amidohydrolase  50.13 
 
 
393 aa  352  7e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4826  amidohydrolase  51.97 
 
 
391 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0781  amidohydrolase  49.48 
 
 
418 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758549  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  50 
 
 
406 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  51.78 
 
 
415 aa  347  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1019  amidohydrolase  48.96 
 
 
428 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.533983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13334  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase amiA1  50.77 
 
 
389 aa  345  7e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  48.56 
 
 
480 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  46.56 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  48.25 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5928  amidohydrolase  48.94 
 
 
417 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1133  amidohydrolase  46.83 
 
 
399 aa  331  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  47.24 
 
 
467 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0823  amidohydrolase  45.76 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4964  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0993  amidohydrolase  47.52 
 
 
421 aa  327  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.491415  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0694  peptidase M20D, amidohydrolase  48.52 
 
 
414 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04870  amidohydrolase  44.25 
 
 
418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.946218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21290  amidohydrolase  46.47 
 
 
413 aa  309  5e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  39.19 
 
 
395 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  36.87 
 
 
394 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  39.25 
 
 
386 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  36.11 
 
 
394 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  38.17 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  38.17 
 
 
392 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  38.17 
 
 
394 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  38.44 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  39.9 
 
 
392 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  36.03 
 
 
398 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  36.03 
 
 
398 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  39.95 
 
 
393 aa  239  6.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  37.24 
 
 
398 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  35.14 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  34.28 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  34.22 
 
 
400 aa  233  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  36.62 
 
 
396 aa  230  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  34.83 
 
 
395 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  34.55 
 
 
391 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  33.33 
 
 
390 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  36.72 
 
 
408 aa  226  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  32.56 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  36.87 
 
 
393 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  37.72 
 
 
396 aa  223  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  35.26 
 
 
392 aa  222  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  35.16 
 
 
389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  36.19 
 
 
387 aa  219  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  37.22 
 
 
395 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  35.39 
 
 
403 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  37.13 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  37.73 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  31.43 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  35.83 
 
 
389 aa  215  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  36.55 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  34.05 
 
 
381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  36.27 
 
 
407 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  35.62 
 
 
405 aa  212  7e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  36.56 
 
 
396 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  36.26 
 
 
387 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  33.69 
 
 
380 aa  211  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  34.96 
 
 
403 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  35.69 
 
 
425 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  36.44 
 
 
385 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  33.24 
 
 
373 aa  210  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  36.26 
 
 
387 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  36.26 
 
 
387 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  31.78 
 
 
394 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  34.21 
 
 
399 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  35.86 
 
 
404 aa  209  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  35.96 
 
 
387 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  35.71 
 
 
399 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  36.26 
 
 
387 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  35.71 
 
 
389 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  32.11 
 
 
394 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.95 
 
 
401 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  36.12 
 
 
389 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  35.34 
 
 
408 aa  207  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  34.04 
 
 
393 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  35.92 
 
 
407 aa  206  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  33.94 
 
 
410 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  36.26 
 
 
387 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  38.34 
 
 
393 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  36.99 
 
 
387 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  34.97 
 
 
381 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  32 
 
 
392 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  35.25 
 
 
381 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>