More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5928 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5928  amidohydrolase  100 
 
 
417 aa  821    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0694  peptidase M20D, amidohydrolase  83.11 
 
 
414 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  57.71 
 
 
410 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  58.14 
 
 
440 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  56.12 
 
 
412 aa  421  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  55.93 
 
 
420 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  55.99 
 
 
406 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  55.44 
 
 
412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  55.38 
 
 
415 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0781  amidohydrolase  53.95 
 
 
418 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758549  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  52.52 
 
 
391 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1019  amidohydrolase  54.43 
 
 
428 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.533983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  50.51 
 
 
399 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21290  amidohydrolase  52.2 
 
 
413 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  52.86 
 
 
401 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2948  amidohydrolase  54.07 
 
 
415 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  53.03 
 
 
415 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0823  amidohydrolase  50.39 
 
 
399 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4964  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0993  amidohydrolase  52.49 
 
 
421 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.491415  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1133  amidohydrolase  49.75 
 
 
399 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  53.12 
 
 
480 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1612  amidohydrolase  50.64 
 
 
391 aa  364  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0803782 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04870  amidohydrolase  48.39 
 
 
418 aa  362  7.0000000000000005e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.946218  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  51.72 
 
 
392 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  50.95 
 
 
467 aa  358  8e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05720  amidohydrolase  53.05 
 
 
426 aa  345  8.999999999999999e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6414  amidohydrolase  51.99 
 
 
423 aa  345  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.820069  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1273  amidohydrolase  51.98 
 
 
390 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1246  peptidase M20D, amidohydrolase  51.98 
 
 
390 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1263  amidohydrolase  51.98 
 
 
390 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.413337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13334  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase amiA1  51.32 
 
 
389 aa  338  7e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4826  amidohydrolase  50.64 
 
 
391 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1358  amidohydrolase  48.94 
 
 
395 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.624162  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0986  amidohydrolase  48.07 
 
 
393 aa  324  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  40.68 
 
 
395 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  37.77 
 
 
398 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  37.77 
 
 
398 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  38.01 
 
 
391 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  36.07 
 
 
395 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  34.68 
 
 
394 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  34.14 
 
 
390 aa  233  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  36.94 
 
 
392 aa  233  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  34.68 
 
 
394 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  35.64 
 
 
400 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  35.92 
 
 
405 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  34.29 
 
 
400 aa  227  3e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  36.1 
 
 
394 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  34.11 
 
 
390 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  36.29 
 
 
398 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  33.5 
 
 
409 aa  223  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  34.96 
 
 
380 aa  223  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  35.16 
 
 
394 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  36.22 
 
 
393 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  35.23 
 
 
397 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  34.11 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  34.81 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  37.57 
 
 
389 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  32.81 
 
 
386 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  36.53 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  32.55 
 
 
390 aa  219  6e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.74 
 
 
381 aa  219  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  35.38 
 
 
397 aa  219  7e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  38.54 
 
 
396 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  35.58 
 
 
396 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  36.46 
 
 
396 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  35.44 
 
 
396 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  33.25 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  34.57 
 
 
403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  34.57 
 
 
403 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  36.91 
 
 
404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  35.7 
 
 
387 aa  216  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  37.2 
 
 
393 aa  216  9e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  32.65 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  33.86 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  33.59 
 
 
381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  32.23 
 
 
391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.48 
 
 
391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.48 
 
 
391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.48 
 
 
391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.48 
 
 
391 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  34.36 
 
 
405 aa  212  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  36.84 
 
 
392 aa  212  9e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  30.99 
 
 
391 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  33.25 
 
 
394 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  32.72 
 
 
381 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  31.97 
 
 
391 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  31.39 
 
 
391 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  33.77 
 
 
395 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  35.25 
 
 
398 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  36.99 
 
 
393 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  36.95 
 
 
393 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  32.23 
 
 
391 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  32.72 
 
 
381 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  34.2 
 
 
389 aa  210  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  31.11 
 
 
393 aa  209  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.12 
 
 
401 aa  209  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  34.55 
 
 
398 aa  209  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  33.07 
 
 
389 aa  209  8e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  32.63 
 
 
386 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  32.38 
 
 
392 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>