More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2948 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2948  amidohydrolase  100 
 
 
415 aa  801    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  73.85 
 
 
401 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1019  amidohydrolase  66.83 
 
 
428 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.533983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0823  amidohydrolase  65.72 
 
 
399 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4964  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0993  amidohydrolase  66.41 
 
 
421 aa  488  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.491415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  62.37 
 
 
415 aa  463  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  57.14 
 
 
399 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04870  amidohydrolase  54.5 
 
 
418 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.946218  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  57.81 
 
 
406 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1133  amidohydrolase  56.88 
 
 
399 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0781  amidohydrolase  55.58 
 
 
418 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758549  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21290  amidohydrolase  54.29 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  51.9 
 
 
440 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  54.47 
 
 
412 aa  395  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5928  amidohydrolase  54.07 
 
 
417 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0986  amidohydrolase  54.08 
 
 
393 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  53.42 
 
 
410 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  54.06 
 
 
415 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05720  amidohydrolase  55.64 
 
 
426 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0694  peptidase M20D, amidohydrolase  55.59 
 
 
414 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  53.66 
 
 
392 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6414  amidohydrolase  53.09 
 
 
423 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.820069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  49.87 
 
 
420 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  51.16 
 
 
412 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1358  amidohydrolase  49.74 
 
 
395 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.624162  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1612  amidohydrolase  53.76 
 
 
391 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0803782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  50.52 
 
 
391 aa  359  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  47.95 
 
 
480 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1246  peptidase M20D, amidohydrolase  54.57 
 
 
390 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1263  amidohydrolase  54.57 
 
 
390 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.413337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4826  amidohydrolase  53.58 
 
 
391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1273  amidohydrolase  54.57 
 
 
390 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  46.15 
 
 
467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13334  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase amiA1  50.52 
 
 
389 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  41.94 
 
 
395 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  34.34 
 
 
394 aa  242  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  34.6 
 
 
394 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  36.83 
 
 
400 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  40.66 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  36.83 
 
 
386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  38.73 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  36.25 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  36.25 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  36.43 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  37.66 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  36.94 
 
 
398 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  35.93 
 
 
405 aa  229  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  38.79 
 
 
392 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  34.7 
 
 
395 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  38.66 
 
 
396 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  36.18 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  34.02 
 
 
394 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  34.44 
 
 
391 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  34.2 
 
 
392 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  38.86 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  34.42 
 
 
407 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  37.31 
 
 
391 aa  221  3e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  33.94 
 
 
394 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  37.08 
 
 
392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  33.59 
 
 
409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  33.76 
 
 
396 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  33.6 
 
 
390 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  38.38 
 
 
395 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  35.9 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  33.08 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  35.94 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  35.73 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  34.62 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  31.65 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.04 
 
 
389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  33.51 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  34.04 
 
 
389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  34.04 
 
 
389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  34.04 
 
 
389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  33.77 
 
 
389 aa  212  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  36.34 
 
 
430 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  38.24 
 
 
407 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  32.49 
 
 
394 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  33.25 
 
 
389 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  33.42 
 
 
392 aa  211  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  37.23 
 
 
387 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  31.55 
 
 
390 aa  211  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2179  amidohydrolase  39.48 
 
 
393 aa  211  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833898  normal  0.575344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  31.48 
 
 
390 aa  210  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  32.98 
 
 
389 aa  209  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  36.48 
 
 
393 aa  209  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  37.24 
 
 
412 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.56 
 
 
389 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  36.61 
 
 
389 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  37.77 
 
 
406 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  38.64 
 
 
389 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1523  M20/M25/M40 family peptidase  31.5 
 
 
404 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000131931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  33.59 
 
 
397 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  37.43 
 
 
395 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  32.56 
 
 
399 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  31.06 
 
 
400 aa  206  4e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  33.25 
 
 
389 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  37.84 
 
 
395 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  36.57 
 
 
389 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  36.44 
 
 
425 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>