More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3542 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  100 
 
 		 406 aa  790    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1019  amidohydrolase  56.57 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.533983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2948  amidohydrolase  56.85 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5928  amidohydrolase  55.99 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  55.32 
 
 		 401 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  57.61 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  53.3 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  55.96 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  53.37 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  55.53 
 
 		 412 aa  395  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0694  peptidase M20D, amidohydrolase  56.38 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  53.95 
 
 		 420 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0993  amidohydrolase  53.73 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.491415  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  51.87 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21290  amidohydrolase  51.95 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  53.58 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0781  amidohydrolase  54.09 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1133  amidohydrolase  52.41 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0823  amidohydrolase  49.62 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  52.41 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04870  amidohydrolase  49.01 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.946218  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  49.87 
 
 		 480 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6414  amidohydrolase  51.93 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.820069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  48.84 
 
 		 467 aa  354  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05720  amidohydrolase  54.62 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1358  amidohydrolase  48.59 
 
 		 395 aa  348  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.624162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  51.76 
 
 		 392 aa  344  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1612  amidohydrolase  48.95 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0986  amidohydrolase  50.27 
 
 		 393 aa  335  7.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1273  amidohydrolase  50.66 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1246  peptidase M20D, amidohydrolase  50.4 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1263  amidohydrolase  50.4 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.413337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4826  amidohydrolase  50.79 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13334  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase amiA1  49.35 
 
 		 389 aa  317  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  41.08 
 
 		 394 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  40.81 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  45.33 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  42.08 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  42.39 
 
 		 393 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  44.02 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  38.54 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  42.39 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  38.11 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  38.71 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  38.71 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  36.94 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  39.06 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  37.4 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  38.38 
 
 		 408 aa  233  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  39.13 
 
 		 396 aa  233  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  37.03 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  38.1 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  36.17 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  34.45 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  35.06 
 
 		 400 aa  229  6e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  35.68 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  34.21 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  35.4 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  37.37 
 
 		 396 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  35.53 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  37.47 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  35.7 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  34.66 
 
 		 386 aa  222  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  31.54 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  38.22 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  35.52 
 
 		 410 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  35.29 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  36.05 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  33.58 
 
 		 392 aa  221  3e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.38 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  37.37 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  34.55 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.66 
 
 		 391 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  36.32 
 
 		 385 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  34.65 
 
 		 391 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  34.97 
 
 		 405 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  36.05 
 
 		 405 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  37.04 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  34.64 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  34.12 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  35.17 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  37.93 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  36.25 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.92 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.92 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.12 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  35.43 
 
 		 394 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  35.83 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  38.12 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  35.92 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  31.89 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  35.85 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  37.34 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  39.89 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  35.66 
 
 		 391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.66 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  34.29 
 
 		 408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  33.6 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  36.36 
 
 		 389 aa  213  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  34.1 
 
 		 391 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>