More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1758 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3785  prolyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 		 565 aa  682    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1758  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 562 aa  1141    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.826128  normal  0.95234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 575 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4057  prolyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 574 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.391162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4090  prolyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 574 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3947  prolyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 575 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 587 aa  536  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 573 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 571 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 570 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 570 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 570 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 572 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 573 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 573 aa  502  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 576 aa  502  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 569 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 568 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 570 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 585 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 566 aa  490  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 575 aa  488  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 572 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 564 aa  488  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 570 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 570 aa  488  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 572 aa  482  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 566 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 566 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 566 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 566 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 566 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 577 aa  480  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 566 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 566 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 574 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 577 aa  478  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 567 aa  475  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 566 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 566 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 574 aa  472  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 573 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 564 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 567 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 576 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 566 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 584 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 580 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 567 aa  465  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 567 aa  465  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 576 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 575 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0808  prolyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 565 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000617993  hitchhiker  0.000236746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 570 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 574 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 578 aa  456  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 571 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 571 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 569 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 579 aa  458  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 567 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 569 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 569 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 578 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 577 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 565 aa  452  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1325  prolyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 567 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000449091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 571 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 569 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0714  prolyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 565 aa  442  9.999999999999999e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 571 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 571 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 568 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 571 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 571 aa  440  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  43.84 
 
 		 570 aa  437  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 571 aa  438  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0897  prolyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 569 aa  438  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.365836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 571 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 571 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 570 aa  438  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 572 aa  438  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 570 aa  438  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 574 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 580 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 582 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10860  prolyl-tRNA synthetase, family II  42.7 
 
 		 588 aa  434  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0568  prolyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 569 aa  434  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.418089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 578 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 580 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 571 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2795  prolyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 590 aa  435  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0605904  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1267  prolyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 581 aa  435  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1793  prolyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 595 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 571 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 569 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>