More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2795 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2795  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 590 aa  1196    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0605904  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 575 aa  528  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 585 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 570 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 570 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 571 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 574 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 573 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 575 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 573 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 572 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 576 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 574 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4057  prolyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 574 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.391162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4090  prolyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 574 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 576 aa  485  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 573 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3947  prolyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 575 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 567 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 572 aa  482  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 580 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 579 aa  476  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 567 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 578 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 578 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 578 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 578 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 578 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 578 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 578 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 578 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 578 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 578 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 578 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 574 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 578 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 578 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 579 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 578 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 578 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 568 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 578 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 566 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 567 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 567 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 581 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 566 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 564 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 568 aa  455  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 576 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 566 aa  458  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 566 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 567 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 583 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 566 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 578 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 580 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 570 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 574 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 564 aa  451  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 569 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 573 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 580 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 574 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 580 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 570 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 574 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 569 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0833  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 580 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 571 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3785  prolyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 565 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 577 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 582 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 573 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 571 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>