More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1267 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1267  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 581 aa  1192    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 570 aa  532  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 573 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 573 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 570 aa  525  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 576 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 585 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 568 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 569 aa  498  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 569 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 570 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 569 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 570 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 569 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 576 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 570 aa  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 567 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 567 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 574 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 573 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 572 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 571 aa  472  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 580 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 575 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 579 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 574 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 574 aa  465  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 566 aa  465  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 575 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 568 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 572 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 570 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 572 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 577 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 578 aa  462  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 577 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 567 aa  455  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 573 aa  458  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 570 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 570 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 564 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 567 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3947  prolyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 575 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 575 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 567 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 584 aa  452  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 576 aa  448  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4057  prolyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 574 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.391162  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2220  prolyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 595 aa  442  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 574 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 578 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1793  prolyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 595 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 578 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 574 aa  443  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 574 aa  444  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 578 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 578 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3563  prolyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4090  prolyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 574 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 566 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 578 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 566 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2498  prolyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 590 aa  441  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.83332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 578 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 578 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 566 aa  439  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 578 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 578 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 566 aa  439  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 582 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 573 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 569 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 580 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 581 aa  431  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 581 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 570 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 571 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 578 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>