More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2220 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2220  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 595 aa  1225    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 578 aa  568  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 572 aa  569  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 570 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 570 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 570 aa  542  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 569 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 572 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 574 aa  538  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 572 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 585 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 570 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 573 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 575 aa  511  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 573 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 570 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 568 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 580 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 571 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 571 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 576 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 571 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 571 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 576 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 571 aa  505  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 573 aa  502  1e-141  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 573 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 577 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 566 aa  498  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 571 aa  498  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 571 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 566 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 566 aa  497  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 566 aa  497  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 566 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 574 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 566 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 571 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 570 aa  496  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 566 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 567 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 577 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 571 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 584 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 566 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 566 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 572 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 575 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 572 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 569 aa  488  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 571 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 572 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 572 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 569 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 572 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 566 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 572 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 571 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 571 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 572 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 572 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 571 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 572 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 572 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 571 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 569 aa  488  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  44.03 
 
 		 572 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 566 aa  487  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 572 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 582 aa  486  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 572 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 572 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 572 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 570 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 570 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 574 aa  484  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 574 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 572 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 572 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 572 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 572 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 580 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 579 aa  475  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 571 aa  478  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 574 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 571 aa  476  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 571 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 569 aa  475  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 571 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 571 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 572 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 574 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 564 aa  475  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 572 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 572 aa  472  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 572 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 571 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>