More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2498 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2498  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 590 aa  1216    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.83332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 570 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 570 aa  588  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 585 aa  588  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 573 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 573 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 574 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 571 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 570 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 572 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 576 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 574 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 573 aa  535  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 578 aa  538  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 567 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 580 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 578 aa  534  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 576 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 578 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 578 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 578 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 578 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 578 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 578 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 575 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 578 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 578 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 567 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 578 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 578 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 578 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 578 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 578 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 569 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 569 aa  524  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 568 aa  525  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 574 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 577 aa  520  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 578 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 578 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 572 aa  518  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 578 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 566 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 579 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 577 aa  514  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 574 aa  511  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 572 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 570 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 574 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 570 aa  511  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 574 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 579 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 574 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 584 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 566 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 566 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 566 aa  503  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 569 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 580 aa  498  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 580 aa  499  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 569 aa  498  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 573 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 570 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 570 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 566 aa  498  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 568 aa  495  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 577 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 571 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 570 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 571 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 571 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 573 aa  492  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0635  prolyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 568 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.401523  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 573 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 571 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 570 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 570 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 571 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 569 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 569 aa  491  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 566 aa  490  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 573 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 571 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 570 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 571 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 576 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 571 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 571 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 574 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 575 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 564 aa  483  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>