More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1399 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 158 aa  316  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  64.34 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  60 
 
 		 156 aa  157  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  56.8 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  54.29 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  55.91 
 
 		 141 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  55.93 
 
 		 144 aa  124  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  53.91 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  60.19 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  45.33 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  52.88 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  50.85 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  49.17 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  47.86 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  49.54 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  48.31 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  40.41 
 
 		 143 aa  107  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  55.21 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  53.27 
 
 		 134 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  54.84 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  48.15 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  46.34 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  46.61 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  49.54 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.94 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  45.76 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  46.73 
 
 		 281 aa  93.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  48.48 
 
 		 250 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 296 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  42.48 
 
 		 305 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  45.54 
 
 		 297 aa  88.6  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  41.12 
 
 		 265 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  49.43 
 
 		 255 aa  87.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 281 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 261 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 286 aa  84.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  42.28 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.14 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  36.72 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 513 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0610  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 305 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 327 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 291 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5551  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 515 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 304 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 288 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 278 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 290 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  35.29 
 
 		 301 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 328 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 296 aa  77.4  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 204 aa  77  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6385  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  40.82 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 296 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>