More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1077 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
384 aa  789    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  67.63 
 
 
386 aa  551  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  67.45 
 
 
384 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  67.99 
 
 
384 aa  531  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  67.28 
 
 
381 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  67.39 
 
 
380 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  63.42 
 
 
387 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  61.26 
 
 
389 aa  488  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  59.63 
 
 
383 aa  489  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  61.52 
 
 
389 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  64.02 
 
 
382 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  59.79 
 
 
387 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  58.42 
 
 
383 aa  478  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  60.21 
 
 
382 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  60.21 
 
 
382 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  60.57 
 
 
387 aa  460  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  59.15 
 
 
382 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  57.71 
 
 
381 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  59.28 
 
 
388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  56.81 
 
 
387 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  56.28 
 
 
387 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  54.23 
 
 
385 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  56.38 
 
 
381 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 
396 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  32.27 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 
376 aa  93.2  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 
378 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 
385 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 
359 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.27 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.41 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  29.48 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
368 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 
380 aa  88.2  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
368 aa  87  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  30.73 
 
 
369 aa  86.3  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  25.29 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.46 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  26.12 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.83 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  27.69 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.57 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  26.97 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
366 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  26.6 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  23.2 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  30.36 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.27 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  26.64 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  26.14 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  26.03 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  28.81 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  28.9 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  26.23 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>