More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3128 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  585  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  84.01 
 
 		 269 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  82.53 
 
 		 269 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  51.53 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  50.76 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  45.56 
 
 		 274 aa  248  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  45.9 
 
 		 273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  47.69 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  46.15 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  47.17 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  49.06 
 
 		 271 aa  241  7.999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  45.15 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  50.38 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  44.78 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  44.61 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  44.7 
 
 		 274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  46.1 
 
 		 278 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  44.12 
 
 		 272 aa  234  9e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  44.32 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  45.33 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  48.15 
 
 		 276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  48.15 
 
 		 276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  48.15 
 
 		 276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  42.65 
 
 		 276 aa  231  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  44.28 
 
 		 275 aa  231  8.000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  43.61 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  46.24 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  44.36 
 
 		 275 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  42.91 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  43.37 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  42.8 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  42.14 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  43.23 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  42.48 
 
 		 277 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  46.07 
 
 		 281 aa  222  7e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  41.06 
 
 		 265 aa  221  9e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  41.91 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  40.32 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  41.42 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  44.66 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  42.48 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  45.02 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  44.78 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  41.54 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  41.54 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  41.6 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  44.8 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  41.54 
 
 		 275 aa  211  9e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  42.26 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  41.79 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  42.16 
 
 		 274 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  41.31 
 
 		 273 aa  208  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  42.86 
 
 		 689 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  38.66 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  44.53 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  41.48 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  43.72 
 
 		 277 aa  198  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  41.76 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  42.05 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  40.74 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  39.31 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  38.91 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  41.22 
 
 		 268 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  39.19 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  39.19 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  38.43 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  39.85 
 
 		 624 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  37.4 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  38.89 
 
 		 280 aa  185  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  38.55 
 
 		 303 aa  185  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  37.55 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  37.36 
 
 		 285 aa  185  8e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  37.69 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  40.28 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  41.6 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  38.69 
 
 		 626 aa  181  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  40.44 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  37.89 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.63 
 
 		 555 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  37.15 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  39.02 
 
 		 618 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  39.08 
 
 		 629 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  38.04 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  37.96 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  37.93 
 
 		 630 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  37.15 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  38.85 
 
 		 612 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  36.29 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  36.76 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  38.32 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  36.76 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  36.76 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  38.72 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  38.02 
 
 		 623 aa  174  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  36.54 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  38.72 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  38.13 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  34.7 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  35 
 
 		 271 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  37.65 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>