More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2088 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  60.73 
 
 		 607 aa  680    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  71.43 
 
 		 586 aa  856    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  60.73 
 
 		 607 aa  679    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  63.18 
 
 		 585 aa  766    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  59.82 
 
 		 594 aa  682    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  70.33 
 
 		 583 aa  841    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  71.26 
 
 		 586 aa  855    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  60.57 
 
 		 574 aa  693    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 582 aa  1180    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  54.32 
 
 		 572 aa  596  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.85 
 
 		 599 aa  548  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  49.17 
 
 		 614 aa  538  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  49.35 
 
 		 579 aa  534  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  49.53 
 
 		 585 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  47.28 
 
 		 582 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  51.3 
 
 		 595 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  48.02 
 
 		 614 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.38 
 
 		 584 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  47.85 
 
 		 584 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  47.23 
 
 		 582 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  51.75 
 
 		 600 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  47.48 
 
 		 584 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.17 
 
 		 602 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  48.79 
 
 		 625 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.79 
 
 		 625 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  48.52 
 
 		 630 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  46.1 
 
 		 587 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  45.35 
 
 		 577 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  41.89 
 
 		 599 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  41.33 
 
 		 584 aa  398  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  38.38 
 
 		 593 aa  369  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  37.91 
 
 		 593 aa  359  9e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  37.22 
 
 		 515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.41 
 
 		 682 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  35.35 
 
 		 597 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.35 
 
 		 597 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  37.01 
 
 		 584 aa  324  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 		 696 aa  323  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  38.05 
 
 		 562 aa  323  5e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  37.64 
 
 		 597 aa  323  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 		 597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  38.32 
 
 		 581 aa  321  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 		 601 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  36.75 
 
 		 579 aa  316  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  35.67 
 
 		 646 aa  286  8e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.09 
 
 		 656 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 		 561 aa  246  9e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  34.62 
 
 		 657 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 		 710 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 		 657 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.3 
 
 		 657 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 		 588 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 		 645 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  32.57 
 
 		 582 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  34.25 
 
 		 583 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 		 614 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32.56 
 
 		 660 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 		 690 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 		 654 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.86 
 
 		 654 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  34.04 
 
 		 582 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.72 
 
 		 577 aa  231  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 		 580 aa  230  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 		 582 aa  230  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 		 590 aa  229  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 		 590 aa  228  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  32.17 
 
 		 580 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 		 570 aa  226  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 		 613 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 		 671 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.43 
 
 		 570 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 		 613 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  32.49 
 
 		 578 aa  223  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 582 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 		 675 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  31.07 
 
 		 601 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 		 662 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 		 595 aa  220  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 		 578 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 		 614 aa  219  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  30.59 
 
 		 646 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  31.4 
 
 		 580 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  32.7 
 
 		 594 aa  219  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 578 aa  219  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 		 594 aa  219  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 		 582 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  33.07 
 
 		 585 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  32.88 
 
 		 581 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 		 595 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 		 586 aa  217  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  31.31 
 
 		 577 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 571 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  31.08 
 
 		 622 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.34 
 
 		 583 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.46 
 
 		 703 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  30.59 
 
 		 578 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 		 587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 		 705 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  30.8 
 
 		 631 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.18 
 
 		 578 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>