More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0681 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  100 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  78.86 
 
 		 247 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  78.46 
 
 		 247 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  77.24 
 
 		 247 aa  401  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  61.13 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  61.69 
 
 		 260 aa  317  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  60.48 
 
 		 260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  60.48 
 
 		 260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  58.02 
 
 		 253 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  58.65 
 
 		 260 aa  284  8e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  54.15 
 
 		 268 aa  281  8.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  54.55 
 
 		 252 aa  278  7e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  54.55 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  53.91 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  55.2 
 
 		 250 aa  272  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  53.09 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  53.6 
 
 		 259 aa  271  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  53.5 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  50.79 
 
 		 263 aa  268  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  53.09 
 
 		 252 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  53.17 
 
 		 263 aa  258  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  52.78 
 
 		 263 aa  255  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  50.97 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  53.01 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  50.97 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  51.36 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  49.8 
 
 		 271 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  50.37 
 
 		 279 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  50.37 
 
 		 262 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  49.8 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  50 
 
 		 262 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  48.85 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  47.96 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  46.95 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  48.88 
 
 		 261 aa  218  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  46.69 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  50.22 
 
 		 286 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  48.12 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  44.66 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  44.06 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  47.22 
 
 		 235 aa  198  7.999999999999999e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  43.86 
 
 		 278 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  45.65 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  48.02 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  42.5 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  44.44 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  46.38 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  50.7 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  38.43 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  38.67 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  41.76 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  41.76 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  41.76 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  41.76 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  38.89 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  41.15 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  41.38 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  41.92 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  40.52 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  41.98 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  42.19 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  48 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  39.85 
 
 		 305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  39.85 
 
 		 305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  44.14 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  40.61 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  37.37 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  45.63 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  39.69 
 
 		 305 aa  161  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  39.22 
 
 		 305 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  45.96 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  40.69 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  39.53 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  39.6 
 
 		 240 aa  158  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  38.26 
 
 		 310 aa  158  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  37.8 
 
 		 304 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  38.37 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  37.59 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  39.47 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  38.3 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  37.63 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  38.61 
 
 		 290 aa  154  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  37.18 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  39.84 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  37.63 
 
 		 332 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  39.36 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  45 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  37.63 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  40.42 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  38.06 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  38.96 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  36.1 
 
 		 321 aa  151  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  43.32 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  43.32 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  37.84 
 
 		 300 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  42.13 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  41.01 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  38.37 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  41.01 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  38.17 
 
 		 301 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>