More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0585 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0585  aminotransferase  100 
 
 		 293 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0832  aminotransferase  74.74 
 
 		 295 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0951  aminotransferase  75 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1251  aminotransferase  71.03 
 
 		 293 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1102  aminotransferase  58.57 
 
 		 290 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5485  aminotransferase  59.3 
 
 		 288 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787347  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1805  aminotransferase  59.79 
 
 		 285 aa  341  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  56.34 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0999  aminotransferase  55 
 
 		 290 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0626  aminotransferase  57.4 
 
 		 284 aa  322  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3773  aminotransferase  57.04 
 
 		 284 aa  321  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.783601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0300  aminotransferase  55.28 
 
 		 284 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3729  aminotransferase  52.14 
 
 		 287 aa  308  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5063  aminotransferase  53.87 
 
 		 288 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4602  aminotransferase  53.17 
 
 		 288 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2277  aminotransferase  54.12 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0891  aminotransferase  53.36 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.413724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2216  aminotransferase  53.41 
 
 		 287 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2837  aminotransferase  53.6 
 
 		 286 aa  288  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0868  aminotransferase  50 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896873 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0508  aminotransferase  45.45 
 
 		 294 aa  258  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6433  aminotransferase  46.57 
 
 		 281 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  32.32 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  31.34 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  33.1 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  30.99 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  29.51 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  28.11 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  27.53 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  31.3 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  27.59 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  32.09 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  25.61 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  30.69 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  27.87 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  31.3 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  29.82 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  28.28 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.11 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  30.66 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  30.4 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  31.4 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  29.7 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  27.61 
 
 		 322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  29.86 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  33.07 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  28.37 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  28.04 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  28.38 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  29.26 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  30.55 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  26.76 
 
 		 287 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  28.06 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  30.55 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  29.71 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  28.06 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4909  aminotransferase class IV  33.86 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  32 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  26.35 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  28.09 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  30.99 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  28.82 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  29.35 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  29.35 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  27.97 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  27.72 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  30.88 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  28.72 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  26.83 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  31.12 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3604  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  30.28 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  26.96 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  30.36 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  27.21 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  27.34 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  29.03 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  29.74 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  28.21 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  28.52 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  26.64 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  27.99 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>