More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1102 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1102  aminotransferase  100 
 
 		 290 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0999  aminotransferase  87.54 
 
 		 290 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  86.76 
 
 		 307 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1805  aminotransferase  71.12 
 
 		 285 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5485  aminotransferase  70.4 
 
 		 288 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787347  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5063  aminotransferase  67.87 
 
 		 288 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4602  aminotransferase  67.87 
 
 		 288 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0300  aminotransferase  57.91 
 
 		 284 aa  348  8e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0585  aminotransferase  58.57 
 
 		 293 aa  345  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3773  aminotransferase  54.87 
 
 		 284 aa  332  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.783601  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0626  aminotransferase  54.15 
 
 		 284 aa  323  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1251  aminotransferase  53.38 
 
 		 293 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0832  aminotransferase  52.86 
 
 		 295 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0951  aminotransferase  53.41 
 
 		 295 aa  308  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3729  aminotransferase  51.99 
 
 		 287 aa  300  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2277  aminotransferase  51.99 
 
 		 287 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2216  aminotransferase  51.99 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0891  aminotransferase  50.89 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.413724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2837  aminotransferase  51.99 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0508  aminotransferase  46.45 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0868  aminotransferase  44.36 
 
 		 287 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896873 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6433  aminotransferase  45.09 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  33.58 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  30.8 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  32.27 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  30.29 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  30.94 
 
 		 322 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  32.2 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  29.81 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  30.65 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  30.12 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  29.58 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  29.37 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  28.97 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  30.65 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  29.92 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  29.58 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  29.92 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  28.68 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  28.11 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  28.71 
 
 		 313 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  28.9 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  28.9 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  31.58 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  27.55 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  29.17 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  29.71 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  29.81 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  28.79 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  30.63 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  29.43 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  29.62 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  28.41 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  29.48 
 
 		 305 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  31.09 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  28.68 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  29.07 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  29.23 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  29.23 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  28.93 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  28.68 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  26.56 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  29.29 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  28.93 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  28.68 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3604  branched-chain amino acid aminotransferase  26.83 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  26.86 
 
 		 302 aa  105  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  30.36 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  28.93 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  29.18 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  28.72 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  28.03 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  28.03 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  31.47 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 307 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 307 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  28.03 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  28.79 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>