More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3773 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3773  aminotransferase  100 
 
 
284 aa  584  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.783601  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0626  aminotransferase  94.01 
 
 
284 aa  554  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0300  aminotransferase  73.85 
 
 
284 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3729  aminotransferase  58.91 
 
 
287 aa  343  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1102  aminotransferase  54.87 
 
 
290 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0585  aminotransferase  57.04 
 
 
293 aa  321  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5485  aminotransferase  57.25 
 
 
288 aa  318  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787347  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1805  aminotransferase  56.52 
 
 
285 aa  318  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2837  aminotransferase  58.12 
 
 
286 aa  318  7e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0197533  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5063  aminotransferase  54.61 
 
 
288 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4602  aminotransferase  54.61 
 
 
288 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.042075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0999  aminotransferase  53.07 
 
 
290 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  53.43 
 
 
307 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1251  aminotransferase  53.52 
 
 
293 aa  305  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2216  aminotransferase  55.44 
 
 
287 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0891  aminotransferase  56.32 
 
 
287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.413724  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2277  aminotransferase  54.51 
 
 
287 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0832  aminotransferase  52.67 
 
 
295 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0951  aminotransferase  53.19 
 
 
295 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0868  aminotransferase  50.18 
 
 
287 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0896873 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0508  aminotransferase  48.41 
 
 
294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6433  aminotransferase  46.13 
 
 
281 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  34.19 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  34.98 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  34.7 
 
 
288 aa  135  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  33.08 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  32.84 
 
 
289 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  33.08 
 
 
288 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  31.64 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  33.21 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  33.21 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  30.29 
 
 
303 aa  127  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 
303 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  31.82 
 
 
322 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  31.72 
 
 
299 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  31.56 
 
 
296 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  30.24 
 
 
318 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  31.72 
 
 
297 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  30.8 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  31.37 
 
 
287 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  32.46 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
307 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
307 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  29.47 
 
 
307 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
307 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
307 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
307 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
307 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
307 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
307 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  32.46 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  27.7 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  32.09 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  30.4 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  29.68 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
309 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  31.8 
 
 
304 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
309 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
309 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  30.39 
 
 
306 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.34 
 
 
305 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
309 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  30.71 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  30.63 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  29.82 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.11 
 
 
286 aa  109  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  30.9 
 
 
307 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 
307 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  30.9 
 
 
307 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  28 
 
 
306 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  27.36 
 
 
309 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  29.54 
 
 
308 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  27.99 
 
 
308 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 
307 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  29.58 
 
 
309 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 
307 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  27.3 
 
 
308 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 
308 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  27.3 
 
 
308 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
307 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  30.1 
 
 
292 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  32.16 
 
 
292 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  27.85 
 
 
312 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  31.27 
 
 
307 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 
308 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  30.31 
 
 
307 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  30.31 
 
 
307 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  30.31 
 
 
307 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>