More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4602 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4602  aminotransferase  100 
 
 		 288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5063  aminotransferase  97.92 
 
 		 288 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1805  aminotransferase  77.42 
 
 		 285 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5485  aminotransferase  73.24 
 
 		 288 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787347  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0999  aminotransferase  68.71 
 
 		 290 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1102  aminotransferase  67.87 
 
 		 290 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  66.07 
 
 		 307 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0300  aminotransferase  57.39 
 
 		 284 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3773  aminotransferase  54.61 
 
 		 284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.783601  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0626  aminotransferase  54.06 
 
 		 284 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1251  aminotransferase  55.48 
 
 		 293 aa  305  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0585  aminotransferase  53.17 
 
 		 293 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2216  aminotransferase  57.25 
 
 		 287 aa  298  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0891  aminotransferase  56.88 
 
 		 287 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.413724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2277  aminotransferase  55.2 
 
 		 287 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0832  aminotransferase  52.8 
 
 		 295 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0951  aminotransferase  52.8 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3729  aminotransferase  52 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2837  aminotransferase  52.71 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0508  aminotransferase  50.18 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0868  aminotransferase  45.82 
 
 		 287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896873 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6433  aminotransferase  43.57 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  33.56 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  31.72 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  33.96 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  30.63 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  31.92 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  34.35 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  32.37 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  32.84 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  32.47 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  33.21 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  32.38 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  31.48 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  32.1 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  32.86 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  32.63 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  30.79 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  28.72 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  30.92 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  31.38 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  31.48 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  30.13 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  31.37 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  32.13 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  31.56 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  28.09 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  30.28 
 
 		 295 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  27.42 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  32.87 
 
 		 308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  29.47 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  29.77 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  29.77 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  31.91 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  29.18 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  31.91 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  27.91 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  30.1 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  28.24 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  30.23 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  32.37 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.77 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  27.84 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  32.05 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  26.76 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  30.59 
 
 		 307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  31.1 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  29.11 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  31.87 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  27.99 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  27 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  31.92 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  28.27 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  28.71 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  28.71 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  30.99 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  29.33 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  28.72 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  28.33 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  28.77 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  29.04 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  27.68 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  30.23 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  30.82 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  26.91 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  29.23 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  28.71 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  31.45 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  32.2 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  28.77 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  28.14 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  29.37 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  29.39 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  28.38 
 
 		 307 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  28.38 
 
 		 307 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>