More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5073 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  100 
 
 		 307 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0999  aminotransferase  87.15 
 
 		 290 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1102  aminotransferase  86.76 
 
 		 290 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1805  aminotransferase  70.04 
 
 		 285 aa  411  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5485  aminotransferase  67.63 
 
 		 288 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787347  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4602  aminotransferase  66.07 
 
 		 288 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5063  aminotransferase  66.07 
 
 		 288 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0585  aminotransferase  56.34 
 
 		 293 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0300  aminotransferase  56.12 
 
 		 284 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3773  aminotransferase  53.43 
 
 		 284 aa  311  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.783601  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0626  aminotransferase  53.07 
 
 		 284 aa  308  9e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0832  aminotransferase  51.07 
 
 		 295 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1251  aminotransferase  51.99 
 
 		 293 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0951  aminotransferase  51.96 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3729  aminotransferase  51.27 
 
 		 287 aa  295  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2277  aminotransferase  50.18 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2216  aminotransferase  49.64 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0891  aminotransferase  48.57 
 
 		 287 aa  268  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.413724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0508  aminotransferase  45.91 
 
 		 294 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2837  aminotransferase  49.1 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0868  aminotransferase  42.91 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896873 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6433  aminotransferase  44.53 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  31.07 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  34.17 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  29.54 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  30.63 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  30.63 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  30.57 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  29.29 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  29.29 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  29.12 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  30.93 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  29.54 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  28.33 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  30.68 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  34.09 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  27.72 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  31.7 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  31.72 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  27.42 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  27.72 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  29.66 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  29.72 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.69 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  29.72 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  30.31 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  27.34 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  27.72 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  29.72 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  29.93 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  28.27 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  29.93 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  29.72 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  32.63 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  29.23 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  31.1 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  28.15 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.72 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  29.72 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  29.68 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.88 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  29.58 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  29.24 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  30.56 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  30.83 
 
 		 293 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  27.66 
 
 		 320 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  30.1 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  29.12 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  28.14 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  30.14 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  28.14 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3604  branched-chain amino acid aminotransferase  27.18 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  29.18 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  29.15 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  27.05 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  28.98 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  28.95 
 
 		 287 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  30.11 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  29.33 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  28.67 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  27.94 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  28.2 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  29.58 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>