200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3436 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  100 
 
 		 127 aa  246  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  63.04 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  48.08 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  48.08 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  43.86 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  55.84 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  58.9 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  48.94 
 
 		 279 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  47.87 
 
 		 279 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  45.16 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  49.02 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  40 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  40 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  46.75 
 
 		 276 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3469  transport-associated  45.13 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  58.82 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  46.6 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4052  transport-associated  45.45 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  44 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  44 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  41.41 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  45.13 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  43.59 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  41.53 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  47.22 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4175  transport-associated protein  45 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  44.78 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  44.3 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  38.05 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  38.94 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  38.94 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  38.94 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  38.94 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  38.94 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  37.61 
 
 		 204 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  37.61 
 
 		 204 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  43.33 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  47.62 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  46.67 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  38.18 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  38.18 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  38.18 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  38.18 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  38.18 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  38.18 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  38.18 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  38.68 
 
 		 204 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  37.27 
 
 		 201 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  43.84 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  41.67 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  45 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  36.89 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  50 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  45.71 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  46.77 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  46.77 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  37.93 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  43.33 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  43.33 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  40 
 
 		 192 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  43.33 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  33.04 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  42.03 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  42.03 
 
 		 273 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  50 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  50 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  42.03 
 
 		 273 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  41.67 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  46.67 
 
 		 202 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  42.53 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  45.76 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  48.44 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  46.67 
 
 		 202 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  42.03 
 
 		 273 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  40.28 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  35.9 
 
 		 201 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  42.86 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  42.86 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  41.75 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  40.62 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  49.18 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  42.86 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  38.03 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  34.92 
 
 		 273 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  49.18 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  43.33 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  44.12 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4816  transport-associated  40.85 
 
 		 258 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  46.88 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  46.88 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  47.54 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  29.55 
 
 		 245 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  39.74 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  43.55 
 
 		 184 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  44.29 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>