More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1638 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2523  acriflavin resistance protein  38.9 
 
 		 1015 aa  679    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1923  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.15 
 
 		 1020 aa  704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1647  acriflavin resistance protein  39.64 
 
 		 1015 aa  709    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  39.33 
 
 		 1015 aa  716    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2636  acriflavin resistance protein  38.87 
 
 		 1015 aa  680    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1828  acriflavin resistance protein  38.8 
 
 		 1025 aa  712    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0227595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  39.71 
 
 		 1025 aa  729    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  39.73 
 
 		 1030 aa  725    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  40 
 
 		 1027 aa  730    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2231  acriflavin resistance protein  39.07 
 
 		 1040 aa  710    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1828  acriflavin resistance protein  38.9 
 
 		 1015 aa  679    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.575203 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.92 
 
 		 1026 aa  782    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1627  acriflavin resistance protein  39.27 
 
 		 1018 aa  698    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1702  acriflavin resistance protein  39.17 
 
 		 1018 aa  694    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  76.85 
 
 		 823 aa  1302    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1026 aa  2072    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2383  acriflavin resistance protein  39.09 
 
 		 1021 aa  698    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2516  acriflavin resistance protein  38.9 
 
 		 1015 aa  679    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560727  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1702  acriflavin resistance protein  39.15 
 
 		 1018 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.2 
 
 		 1019 aa  733    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1050 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1044 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.22 
 
 		 1044 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1017 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 		 1011 aa  452  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1046 aa  449  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1034 aa  442  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 		 1040 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2528  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1053 aa  432  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.263443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1043 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1024 aa  429  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 		 1023 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1027 aa  412  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1034 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1044 aa  411  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  27.38 
 
 		 1038 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  29.15 
 
 		 1050 aa  405  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1027 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 		 1048 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1043 aa  395  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1470 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1039 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1071 aa  389  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  29.15 
 
 		 1028 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  29.76 
 
 		 1026 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1032 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.44 
 
 		 1024 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1038 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1034 aa  379  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.76 
 
 		 1049 aa  375  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1059 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.97 
 
 		 1496 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1036 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1063 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1028 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1058 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1028 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1041 aa  364  5.0000000000000005e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1039 aa  363  8e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.94 
 
 		 1024 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.75 
 
 		 1036 aa  363  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1083 aa  363  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1045 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1058 aa  362  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1027 aa  360  9e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1055 aa  360  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1041 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1065 aa  355  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1058 aa  353  7e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1014 aa  353  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1028 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.35 
 
 		 1053 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1044 aa  351  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1051 aa  350  8e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1047 aa  348  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1041 aa  348  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 		 1029 aa  348  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1051 aa  346  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  26.14 
 
 		 1050 aa  345  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1038 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1062 aa  345  4e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1048 aa  344  5e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  26.66 
 
 		 1051 aa  343  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1055 aa  343  9e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1054 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1054 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1006 aa  341  5e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1031 aa  340  7e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1041 aa  339  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1054 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1028 aa  335  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  26.38 
 
 		 1040 aa  335  3e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  27.53 
 
 		 1035 aa  334  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1044 aa  334  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3691  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1041 aa  330  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1042 aa  330  8e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.31 
 
 		 1034 aa  330  9e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  25.23 
 
 		 1071 aa  330  1.0000000000000001e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1050 aa  329  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01699  RND family efflux transporter  27.14 
 
 		 1038 aa  328  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>