171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6060 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6060  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 510 aa  1026    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4731  WD40 domain protein beta Propeller  52.6 
 
 		 509 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2352  fibronectin, type III domain-containing protein  33.53 
 
 		 494 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 		 646 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  28.74 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  32.2 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.23 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  26.46 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  27.87 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  30.56 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  23.33 
 
 		 615 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  40.4 
 
 		 730 aa  61.6  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 		 721 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4589  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  32.92 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.66 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  26.58 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 969 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  28.35 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  25.7 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.4 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  30.91 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.74 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.18 
 
 		 429 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  27.71 
 
 		 434 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.84 
 
 		 292 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  26.02 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 		 642 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  24.81 
 
 		 1049 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  26.98 
 
 		 1113 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  27.71 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  27.71 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1561  WD40 domain-containing protein  25.89 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  34.13 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1042 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 430 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  26.18 
 
 		 425 aa  54.7  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.22 
 
 		 407 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.8 
 
 		 1583 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  24.81 
 
 		 1062 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 		 771 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  24.91 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  24.71 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  23.72 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  42.62 
 
 		 618 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  25.11 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  29.55 
 
 		 1111 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  27.23 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  42.62 
 
 		 629 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.71 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3925  WD40 domain protein beta Propeller  35.54 
 
 		 647 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329588  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  27.46 
 
 		 1060 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  23.16 
 
 		 453 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  24.44 
 
 		 1062 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.79 
 
 		 1547 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.66 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  24.35 
 
 		 430 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  24.44 
 
 		 1062 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  23.53 
 
 		 1005 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  27.1 
 
 		 1062 aa  52  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  24.88 
 
 		 1062 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  31.25 
 
 		 1040 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  31.25 
 
 		 1042 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  25.29 
 
 		 445 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  24.81 
 
 		 1062 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  24.07 
 
 		 436 aa  51.2  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  28.4 
 
 		 437 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3367  hypothetical protein  25.11 
 
 		 557 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000828737  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  23.27 
 
 		 354 aa  50.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  25.73 
 
 		 435 aa  50.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  25.93 
 
 		 441 aa  50.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  29.82 
 
 		 442 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24 
 
 		 430 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  28.05 
 
 		 457 aa  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  27.27 
 
 		 462 aa  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2847  WD40 domain-containing protein  25 
 
 		 357 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  26.44 
 
 		 1071 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.87 
 
 		 1062 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  27.01 
 
 		 416 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  25.51 
 
 		 352 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.87 
 
 		 1684 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3364  hypothetical protein  25.7 
 
 		 551 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00271389  normal  0.0159799 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  30.47 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  25.45 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  22.36 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  40.62 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  40.62 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.5 
 
 		 1609 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.64 
 
 		 1066 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  32.2 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  24.85 
 
 		 648 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.39 
 
 		 298 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.65 
 
 		 1598 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  29.56 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_002620  TC0888  translocation protein TolB  25.82 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  27.23 
 
 		 970 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  23.38 
 
 		 451 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  23.78 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.17 
 
 		 1078 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.6 
 
 		 656 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>