162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1633 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  100 
 
 		 330 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1765  NmrA-like  33.12 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0815614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  31.86 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  30.17 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  29.79 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  30.69 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  27.27 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  28.76 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  26.06 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  27.18 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  27.18 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  25.17 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  30.2 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  27.5 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  24.61 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  27.24 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  25.99 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  25.35 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  24.22 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37667  predicted protein  24.8 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.658602  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  30.9 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  27.88 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  29.32 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  28.11 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  25.51 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  27.86 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  26.53 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  24.32 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  22.9 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  25.35 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  27.42 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  23.87 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  24.58 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  24.91 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  29.13 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  26.52 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  30.57 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  27.34 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  30.57 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  30.57 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  30 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  25 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  25.8 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  25.91 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  23.04 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  24.14 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  24.14 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  26.84 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  24.12 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  25.1 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  25.28 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  25.28 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  25.76 
 
 		 274 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  23.11 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  24.73 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  23.91 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  29.91 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  26.74 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5254  NmrA-like protein  24.77 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5343  NmrA family protein  24.77 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663839  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  27.32 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  26.59 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5633  NmrA family protein  23.29 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  24.77 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  22.12 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  24.77 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  23.56 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  24.91 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  25.69 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.27 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  24.83 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  23.29 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.12 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  27.71 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.43 
 
 		 320 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  23.93 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  26.32 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  24.53 
 
 		 284 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  24.31 
 
 		 287 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  25.57 
 
 		 277 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  24.14 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  25.88 
 
 		 293 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  25.23 
 
 		 271 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.14 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  24.89 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  24.48 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  26.36 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  22.98 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  24.79 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.79 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  26.23 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  24.41 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  24.2 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.11 
 
 		 291 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.56 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  24.14 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49151  predicted protein  22.63 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  25.95 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>