91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49151 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49151  predicted protein  100 
 
 
345 aa  720    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47077  predicted protein  39.09 
 
 
328 aa  230  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0255918  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37667  predicted protein  35.1 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.658602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  24.92 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  23.12 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  24.09 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  23.22 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  23.58 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.92 
 
 
279 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  21.68 
 
 
274 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  23.02 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  24.91 
 
 
284 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  21.8 
 
 
285 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  22.62 
 
 
271 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  25.42 
 
 
294 aa  59.7  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  23.19 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  22.57 
 
 
287 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  19.94 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  21.34 
 
 
434 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  22.14 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  22.36 
 
 
293 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  23.02 
 
 
281 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  24.22 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  23.32 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  24.43 
 
 
288 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  23.75 
 
 
281 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  20.82 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  23.62 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  23.62 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  23.62 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  24.68 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  22.63 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  24.13 
 
 
295 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  20.44 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  23.62 
 
 
286 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  21.2 
 
 
292 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  23.33 
 
 
274 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  22.86 
 
 
294 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  23.62 
 
 
286 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  23.62 
 
 
286 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  22.27 
 
 
299 aa  49.3  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  24.59 
 
 
276 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  23.88 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  23.88 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  21.46 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  23.7 
 
 
310 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  23.32 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  23.3 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  23.9 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  23.9 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  20.32 
 
 
295 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  25.25 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  23.3 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  20.83 
 
 
283 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  23.66 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  23.45 
 
 
285 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  19.84 
 
 
285 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  27.34 
 
 
292 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  24.92 
 
 
274 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  21.75 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  27.6 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  21.07 
 
 
279 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  21.35 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  23 
 
 
282 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  20.83 
 
 
280 aa  46.2  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  22.48 
 
 
301 aa  46.2  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  19.1 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  20.87 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  20.93 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.95 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  20.45 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  21.29 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  22.33 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  20.49 
 
 
274 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  20.34 
 
 
329 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  23 
 
 
282 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  19.84 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  21.74 
 
 
295 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  23.72 
 
 
293 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  19.38 
 
 
294 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  22.52 
 
 
285 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 
291 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  22.68 
 
 
282 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.97 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  19.12 
 
 
279 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  21.94 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  20 
 
 
312 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  22.68 
 
 
282 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  36.14 
 
 
284 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  22.32 
 
 
278 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.55 
 
 
324 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>