50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0639 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
231 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  63.73 
 
 
212 aa  244  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
1444 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.66 
 
 
1505 aa  92  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  25.97 
 
 
1194 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  31.98 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  30.85 
 
 
453 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  26.89 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  30.33 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  31.34 
 
 
1140 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  29.82 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  25.78 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  30.45 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  28.63 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  31.36 
 
 
455 aa  68.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  26.18 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  30.09 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  28.44 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  29.06 
 
 
1145 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  27.91 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  25.68 
 
 
234 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  30.53 
 
 
326 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  30.96 
 
 
451 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2463  hypothetical protein  29.05 
 
 
257 aa  62.4  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 
226 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2104  hypothetical protein  27.06 
 
 
894 aa  62  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.788762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  27.4 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  25.91 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  30.59 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  27.04 
 
 
515 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  27.05 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  27.6 
 
 
322 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  30 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  28.79 
 
 
193 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  24.17 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  24.29 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2243  protein of unknown function DUF1080  26.07 
 
 
884 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  27.09 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  28.82 
 
 
453 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  26.27 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  31.33 
 
 
440 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  30.06 
 
 
452 aa  51.6  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  25.79 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  33.13 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  30.18 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  26.02 
 
 
321 aa  48.9  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  23.89 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  26.99 
 
 
255 aa  45.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  26.47 
 
 
234 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>