More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  100 
 
 		 606 aa  1235    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  67.82 
 
 		 600 aa  860    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  54.32 
 
 		 619 aa  615  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  41.67 
 
 		 581 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  39.96 
 
 		 606 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 592 aa  291  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  33.8 
 
 		 635 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  34.11 
 
 		 618 aa  267  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  30.92 
 
 		 592 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  31.86 
 
 		 611 aa  246  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  31.26 
 
 		 604 aa  197  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.46 
 
 		 586 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 581 aa  167  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 548 aa  160  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  28.18 
 
 		 555 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 548 aa  153  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  25.97 
 
 		 557 aa  151  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 549 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 549 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 549 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 597 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 550 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 555 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 555 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.9 
 
 		 585 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 563 aa  110  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  24.44 
 
 		 591 aa  107  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.11 
 
 		 579 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  22.84 
 
 		 570 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 508 aa  91.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 639 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.41 
 
 		 567 aa  90.9  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  21.1 
 
 		 567 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  22.98 
 
 		 568 aa  88.2  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 617 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 		 592 aa  84.7  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.86 
 
 		 578 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 567 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  22.54 
 
 		 576 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.67 
 
 		 567 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 		 512 aa  78.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  24.6 
 
 		 566 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.92 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 586 aa  76.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 591 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  23.03 
 
 		 575 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 610 aa  73.9  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 492 aa  73.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 603 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.29 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.31 
 
 		 593 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  23.28 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  24.7 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  23.28 
 
 		 575 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  32.56 
 
 		 506 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 529 aa  72  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  21.1 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.59 
 
 		 536 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.46 
 
 		 593 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 501 aa  70.9  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  30.33 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.93 
 
 		 575 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  23.93 
 
 		 575 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.55 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 575 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.55 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.55 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  22 
 
 		 536 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 544 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 535 aa  70.1  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.78 
 
 		 559 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.3 
 
 		 575 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.16 
 
 		 593 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 599 aa  69.7  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.91 
 
 		 536 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.67 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.61 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  23.54 
 
 		 566 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.11 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  22.02 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  29.8 
 
 		 683 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.67 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 533 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 553 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.85 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 604 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.28 
 
 		 555 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  22.28 
 
 		 635 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 		 503 aa  67  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 554 aa  67  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>