228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08840 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  100 
 
 		 296 aa  593  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09070  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  44.33 
 
 		 295 aa  237  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00126145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  42.81 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  42.46 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0860  ABC-2 type transporter  40.4 
 
 		 324 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27980  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.56 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.67 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  40.88 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  34.88 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26460  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.81 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2587  ABC-2 type transporter  34.46 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7634  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 570 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  29.93 
 
 		 604 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 606 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  25.83 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 633 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  24.62 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 263 aa  92.4  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  22.85 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  23.72 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  29.23 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  25.43 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  27.03 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  23.26 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  25.28 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  25.73 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2634  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.79755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3015  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  26.69 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0998219  hitchhiker  0.0000148494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  24.27 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  25.11 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0431  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  22.3 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  25.55 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  23.27 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  23.27 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  25.28 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  23.31 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  23.86 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  24.75 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  23.26 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  22.87 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  26.23 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  22.18 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  22.46 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4146  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  hitchhiker  0.00000138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0297  tagG protein, teichoic acid ABC transporter protein, putative  23.39 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  24.9 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  25.98 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  25.93 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  24.47 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  24.47 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0208  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  27.85 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  24.56 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  23.28 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  23.28 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  22.31 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  25.5 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>