78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3544 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3544  TonB family protein  100 
 
 		 145 aa  300  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.788669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3888  TonB family protein  56.85 
 
 		 147 aa  183  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1642  TonB family protein  47.41 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  41.77 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  39.24 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  39.24 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  37.97 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2467  hypothetical protein  54 
 
 		 50 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  33.33 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  37.97 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3515  TonB family protein  30.39 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0209136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  36.71 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  36.71 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  36.25 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  36.71 
 
 		 206 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  36.71 
 
 		 206 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  36.71 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  36.71 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  32.1 
 
 		 207 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  36.71 
 
 		 207 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  36.71 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  36.71 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  32.05 
 
 		 405 aa  50.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  30.38 
 
 		 202 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  34.18 
 
 		 207 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  34.62 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  31.71 
 
 		 204 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  30.11 
 
 		 223 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  32.05 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  32.79 
 
 		 391 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  32.91 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2868  hypothetical protein  28.83 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  33.33 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  30 
 
 		 203 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2645  TonB domain-containing protein  22.66 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  30 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  30.36 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  30.36 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  30 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  28.75 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  28.75 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  31.88 
 
 		 462 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  29.11 
 
 		 219 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  28.75 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  30.26 
 
 		 397 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  30.36 
 
 		 249 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  31.58 
 
 		 403 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  28.99 
 
 		 371 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  28.57 
 
 		 371 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  27.59 
 
 		 244 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  27.59 
 
 		 239 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  28.57 
 
 		 242 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  28.57 
 
 		 242 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  27.59 
 
 		 239 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  27.59 
 
 		 239 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  27.59 
 
 		 239 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  29.29 
 
 		 349 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  27.91 
 
 		 417 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  27.59 
 
 		 239 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  27.59 
 
 		 239 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  29.11 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  39.06 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  28.24 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  27.16 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  27.59 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  28.57 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  28.57 
 
 		 240 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  28.57 
 
 		 240 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  27.59 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  29.63 
 
 		 404 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  31.25 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  27.14 
 
 		 264 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  26.79 
 
 		 238 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  30.77 
 
 		 368 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  29.35 
 
 		 361 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  28.57 
 
 		 396 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  26.58 
 
 		 248 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>