More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3685 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 238 aa  494  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  69.17 
 
 		 239 aa  338  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  67.63 
 
 		 239 aa  325  5e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  62.87 
 
 		 236 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  62.45 
 
 		 236 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  62.45 
 
 		 236 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  62.03 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  62.03 
 
 		 235 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  62.03 
 
 		 235 aa  292  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  62.03 
 
 		 235 aa  292  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  62.03 
 
 		 235 aa  291  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  63.26 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  60.75 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  54.77 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.91 
 
 		 239 aa  175  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  38.91 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  41.09 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  33.93 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  32.34 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  30 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  35.98 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  35.08 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  31.49 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0643  ABC transporter related  33.68 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  31.44 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  31.88 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  33 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  30.52 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  31.96 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  31.51 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  31.51 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  31.96 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  31.51 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  30.23 
 
 		 334 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.14 
 
 		 366 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  31.51 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  31.51 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0742  ABC transporter, ATP-binding protein  34.86 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0290801  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1648  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  31.51 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  31.05 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  30.97 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  31.05 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  30.52 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0807  ABC transporter-related protein  29.39 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.147643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  32.31 
 
 		 311 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  30.14 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  31.08 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  29.26 
 
 		 372 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  35.14 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  30.92 
 
 		 512 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.5 
 
 		 388 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  28.82 
 
 		 372 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  32.41 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  31.75 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  29.91 
 
 		 355 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  30.63 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  32.14 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  30.63 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  31.94 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  30.63 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  30.63 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  29.34 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  32.14 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  30.63 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  29.46 
 
 		 354 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  30.63 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  30.04 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  30.6 
 
 		 362 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  30.63 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4045  ABC transporter related  34.29 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2416  ABC transporter related  32.73 
 
 		 505 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  30.81 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  28.7 
 
 		 360 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  29.81 
 
 		 333 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  30.95 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  31.79 
 
 		 325 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  36.87 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  29.86 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  29.38 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.55 
 
 		 363 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  30.81 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  30.17 
 
 		 388 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0164  ABC transporter related  36.11 
 
 		 587 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  30.52 
 
 		 310 aa  101  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  31.68 
 
 		 311 aa  101  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  31.3 
 
 		 370 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0732  cell division ATP-binding protein FtsE  30.19 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6366  ABC transporter related  29.58 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0766362  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  31.96 
 
 		 319 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.98 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  31.41 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>