266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01020 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01020  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  100 
 
 
108 aa  224  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.141102 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  64.76 
 
 
255 aa  145  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  54.13 
 
 
106 aa  124  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  58.88 
 
 
105 aa  122  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1625  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  48.51 
 
 
104 aa  110  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1085  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  48.15 
 
 
105 aa  110  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0564788  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.22 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.24 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.35 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.25 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.74 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.25 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1800  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.3 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1940  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.3 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  37.63 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.11 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 
105 aa  77  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  34.65 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  35.92 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.65 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.65 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.65 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  34.65 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  33.66 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  34.58 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 
244 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5463  carboxymuconolactone decarboxylase  32.29 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245296  normal  0.0559461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1752  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00315461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  33.33 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  34.31 
 
 
256 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.04 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  34.41 
 
 
396 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1515  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.76 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.58 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  32.63 
 
 
259 aa  67.8  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  33.33 
 
 
298 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  34.41 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  38.75 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2806  carboxymuconolactone decarboxylase  30.69 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 
239 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  30.93 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  29.52 
 
 
265 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  33.98 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.44 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.93 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.63 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  34.88 
 
 
264 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.44 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.9 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.33 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.96 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.21 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  30.21 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  31.78 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.87 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.87 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4519  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 
125 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591188  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 
128 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  39.47 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  30.53 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  27.66 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  29.47 
 
 
283 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  29.47 
 
 
283 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  28.04 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.37 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  32.38 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  30.53 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.84 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.72 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.53 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.66 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.11 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  24.21 
 
 
262 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  29.03 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.47 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.27 
 
 
281 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.24 
 
 
393 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  32.58 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.07 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.07 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  29.03 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.1 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  29.9 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.17 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
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