287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3845 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
371 aa  772    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  57.6 
 
 
345 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  56.65 
 
 
366 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  57.48 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  55.59 
 
 
349 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  54.31 
 
 
358 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  55.43 
 
 
344 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  55.39 
 
 
350 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  54.97 
 
 
373 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  53.73 
 
 
354 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  50.43 
 
 
359 aa  345  8e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  44.73 
 
 
352 aa  269  7e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  40.35 
 
 
342 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  39.72 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  38.89 
 
 
375 aa  233  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  37.63 
 
 
374 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  39.03 
 
 
365 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  35.84 
 
 
340 aa  202  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  35.62 
 
 
373 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  34.49 
 
 
362 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  34.98 
 
 
359 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  30.73 
 
 
395 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.65 
 
 
357 aa  144  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  31.07 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.16 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.73 
 
 
397 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 
488 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 
465 aa  135  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.83 
 
 
389 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  28.9 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 
361 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  30.67 
 
 
355 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 
398 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.69 
 
 
362 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
385 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
434 aa  123  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  25.38 
 
 
438 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  28.39 
 
 
652 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.62 
 
 
387 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  30.32 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 
320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.95 
 
 
423 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.27 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 
370 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
318 aa  116  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  25.99 
 
 
489 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 
657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.02 
 
 
415 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  35.21 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.22 
 
 
468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 
365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.71 
 
 
671 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
349 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  30.1 
 
 
418 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  30.1 
 
 
418 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.29 
 
 
431 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  26.07 
 
 
313 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  27.5 
 
 
431 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 
313 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.22 
 
 
375 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  23.61 
 
 
360 aa  103  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.47 
 
 
424 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  29.86 
 
 
364 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 
421 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  39.31 
 
 
434 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 
320 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  26.99 
 
 
443 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  29.07 
 
 
386 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  37.36 
 
 
446 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  26.89 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  25.6 
 
 
686 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  24.68 
 
 
468 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
452 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  25.6 
 
 
698 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  26.17 
 
 
689 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 
309 aa  95.1  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  27.05 
 
 
615 aa  93.6  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  31.52 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
390 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 
358 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 
358 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 
438 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  23.09 
 
 
450 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  24.87 
 
 
474 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.29 
 
 
405 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 
402 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  27.44 
 
 
440 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  27.44 
 
 
440 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  23.71 
 
 
388 aa  87  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  24.1 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  25.14 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>