More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1831 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  100 
 
 		 495 aa  1013    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  49.9 
 
 		 792 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  46.18 
 
 		 926 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  46.88 
 
 		 808 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2546  ribonuclease E  47.28 
 
 		 806 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147077  hitchhiker  1.1855699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  46.69 
 
 		 741 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  46.86 
 
 		 919 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  44.87 
 
 		 866 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  48.62 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1242  ribonuclease  49.36 
 
 		 928 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  46.57 
 
 		 1056 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0818  ribonuclease  48.4 
 
 		 1092 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00158382  normal  0.513461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2922  ribonuclease, Rne/Rng family  47.97 
 
 		 1097 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000705961  normal  0.54344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2275  RNAse E  47.75 
 
 		 1042 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896581  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1062  ribonuclease E  47.97 
 
 		 1096 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  0.00000580995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2440  RNAse E  47.75 
 
 		 1037 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1069  ribonuclease  47.76 
 
 		 1056 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17751  decreased coverage  0.00648425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1040  ribonuclease E protein  47.54 
 
 		 1014 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2802  ribonuclease E  47.97 
 
 		 1088 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000361809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2863  ribonuclease E  47.97 
 
 		 1088 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1814  ribonuclease E  47.97 
 
 		 1087 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0112079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0520  ribonuclease E  47.97 
 
 		 1090 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000787566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2918  ribonuclease E  47.97 
 
 		 1085 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000100731  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  47.97 
 
 		 1111 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  47.97 
 
 		 1053 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1707  ribonuclease E  47.97 
 
 		 1068 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000337375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2491  ribonuclease E  47.97 
 
 		 1090 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  45.95 
 
 		 903 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2791  ribonuclease E  47.97 
 
 		 1087 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000882056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0631  ribonuclease  47.76 
 
 		 1059 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0577121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  48.6 
 
 		 1073 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  47.76 
 
 		 1059 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0986  ribonuclease  47.76 
 
 		 1068 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1110  ribonuclease  47.76 
 
 		 1059 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0970  ribonuclease, Rne/Rng family  46.9 
 
 		 1008 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0905  ribonuclease, Rne/Rng family  46.9 
 
 		 1011 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0755598  normal  0.0613595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  46.01 
 
 		 1073 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1619  RNAse E  45.95 
 
 		 968 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000868095  normal  0.696665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0457  ribonuclease, Rne/Rng family  44.28 
 
 		 489 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  46.27 
 
 		 1057 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  45.51 
 
 		 1012 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  45.51 
 
 		 1071 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  46.01 
 
 		 1072 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  45.4 
 
 		 1139 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1905  ribonuclease, Rne/Rng family  45.81 
 
 		 1091 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.879394  unclonable  0.000000947805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  45.4 
 
 		 1082 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0389  ribonuclease  45.34 
 
 		 879 aa  415  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.57215  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1321  ribonuclease E  45.94 
 
 		 904 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0034947  normal  0.881501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1481  ribonuclease  45.81 
 
 		 1086 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00984617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2220  ribonuclease, Rne/Rng family  46.23 
 
 		 782 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3809  ribonuclease  45.81 
 
 		 1090 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000518974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1874  ribonuclease, Rne/Rng family  46.23 
 
 		 782 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000717737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2643  ribonuclease, Rne/Rng family  47.61 
 
 		 1029 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  45.61 
 
 		 1128 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  45.4 
 
 		 1120 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  46.15 
 
 		 938 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2511  ribonuclease E  46.27 
 
 		 1113 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00474333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  45.06 
 
 		 1175 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0396  ribonuclease, Rne/Rng family  45.34 
 
 		 865 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3290  ribonuclease E  47.61 
 
 		 1025 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2005  ribonuclease E  45.29 
 
 		 870 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0703  ribonuclease  44.35 
 
 		 752 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1064  ribonuclease  46.47 
 
 		 977 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.973146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5282  ribonuclease  46.14 
 
 		 1044 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0972122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3349  ribonuclease, Rne/Rng family  45.8 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  45.62 
 
 		 1065 aa  408  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1615  ribonuclease, Rne/Rng family  46.27 
 
 		 1058 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000319313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1898  ribonuclease E  47.21 
 
 		 1122 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000446531  hitchhiker  0.000483574 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1756  ribonuclease, Rne/Rng family  45.36 
 
 		 1016 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000532878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3507  ribonuclease E  47 
 
 		 1216 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0058516  normal  0.0230667 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1677  ribonuclease E  47 
 
 		 1216 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000377607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1569  ribonuclease E  47 
 
 		 1216 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000219809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1579  ribonuclease, Rne/Rng family  46.47 
 
 		 1060 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00521114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2436  ribonuclease, Rne/Rng family  44.76 
 
 		 1061 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1481  ribonuclease E  47.42 
 
 		 885 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00665357  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1173  ribonuclease E  46.96 
 
 		 1040 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2843  ribonuclease E and G  45.15 
 
 		 764 aa  405  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  47.17 
 
 		 1074 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  44.74 
 
 		 1132 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2816  ribonuclease E  45.85 
 
 		 1121 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00267025  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  44.74 
 
 		 1132 aa  405  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  40.54 
 
 		 537 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0592  ribonuclease  45.96 
 
 		 1058 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0452769 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1615  ribonuclease E  45.21 
 
 		 688 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3086  ribonuclease  46.25 
 
 		 1076 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002988  ribonuclease E  46.85 
 
 		 1024 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  46.27 
 
 		 1035 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0656  ribonuclease E  45.55 
 
 		 998 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3660  ribonuclease E  46.04 
 
 		 1041 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0715  ribonuclease E  46.04 
 
 		 942 aa  400  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.32082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2678  ribonuclease, Rne/Rng family  45.84 
 
 		 1091 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.174133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01517  ribonuclease E  44.54 
 
 		 1238 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1564  RNAse E  44.35 
 
 		 873 aa  398  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.270508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1989  ribonuclease E  44.89 
 
 		 1141 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378047  normal  0.0201653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2149  RNAse E  44.05 
 
 		 889 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0282  ribonuclease  43.48 
 
 		 1449 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.936888  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4788  ribonuclease  46.1 
 
 		 1038 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.870424  normal  0.38307 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  44.79 
 
 		 1015 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2134  ribonuclease  44.79 
 
 		 1070 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1720  ribonuclease  45.82 
 
 		 1007 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>