59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4549 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  98.47 
 
 		 784 aa  1564    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  100 
 
 		 784 aa  1585    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  97.96 
 
 		 784 aa  1537    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.73 
 
 		 817 aa  298  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.93 
 
 		 825 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  32.22 
 
 		 993 aa  226  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  52.67 
 
 		 887 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.03 
 
 		 877 aa  137  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  22.68 
 
 		 781 aa  126  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  22.76 
 
 		 814 aa  114  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.27 
 
 		 950 aa  111  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  27.13 
 
 		 739 aa  102  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  27.13 
 
 		 739 aa  102  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  27.44 
 
 		 739 aa  102  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.5 
 
 		 823 aa  102  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  40.83 
 
 		 986 aa  100  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3393  tail tape measure protein  24.1 
 
 		 916 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.36 
 
 		 743 aa  94  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3062  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  23.88 
 
 		 1089 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0911019 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  32.54 
 
 		 919 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  33.01 
 
 		 920 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  23.36 
 
 		 1314 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  27.83 
 
 		 1216 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  33.78 
 
 		 775 aa  72  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  27.51 
 
 		 824 aa  70.5  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.23 
 
 		 1032 aa  70.5  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1857  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  24.42 
 
 		 814 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  28.4 
 
 		 666 aa  69.3  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.45 
 
 		 959 aa  68.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  23.14 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  28.91 
 
 		 877 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  23.93 
 
 		 642 aa  62  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  54 
 
 		 1078 aa  61.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  23.93 
 
 		 641 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  22.97 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  22.49 
 
 		 738 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  26.67 
 
 		 971 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  26.67 
 
 		 971 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  48.08 
 
 		 540 aa  54.7  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  30.3 
 
 		 596 aa  53.5  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.28 
 
 		 719 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  23.38 
 
 		 956 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  30.61 
 
 		 701 aa  52.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2337  Phage tail tape measure protein  25.45 
 
 		 599 aa  52.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  30.89 
 
 		 1025 aa  52  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  27.62 
 
 		 1025 aa  51.6  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  42.86 
 
 		 590 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  51.43 
 
 		 935 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  51.43 
 
 		 935 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  24.33 
 
 		 1030 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  34.85 
 
 		 815 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  20.62 
 
 		 680 aa  48.1  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  35.29 
 
 		 459 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  33.33 
 
 		 815 aa  47  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  24.1 
 
 		 925 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  28.67 
 
 		 809 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0190  hypothetical protein  22.97 
 
 		 735 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  37.93 
 
 		 714 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  28.74 
 
 		 737 aa  44.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>