256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4136 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4136  cyclic nucleotide-binding domain protein  100 
 
 		 233 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4121  cyclic nucleotide-binding domain protein  99.57 
 
 		 263 aa  480  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0388  cyclic nucleotide-binding protein  23.79 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.93 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  24.88 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.8 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.63 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  21.46 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.28 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.29 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.28 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0312  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.48 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.71 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.33 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.76 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.68 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.16 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.35 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  21.86 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.75 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  25.99 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.88 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  22.16 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.74 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.55 
 
 		 354 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  18.92 
 
 		 355 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.11 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.1 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.55 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0525745  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1904  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603838  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.72 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.03 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.73 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.04 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.04 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.04 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.04 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.04 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  23.04 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  23.04 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  23.04 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  21.13 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  21.82 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  28.85 
 
 		 621 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2104  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.86 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  22.96 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  22 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.27 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.1 
 
 		 348 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1578  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  22.16 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0390  cyclic nucleotide-binding protein  22.63 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  23.79 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.66 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  21.13 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  21.95 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.5 
 
 		 352 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.1 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  23.3 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  23.3 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  23.3 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  23.3 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.73 
 
 		 624 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  23.3 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  21.24 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.78 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  23.3 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  23.3 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1583  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.3 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  23.3 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  23.3 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>