More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0534 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  68.28 
 
 		 268 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  66.42 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  65.93 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  68.28 
 
 		 268 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  67.68 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  66.79 
 
 		 268 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  66.42 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  66.79 
 
 		 268 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  68.28 
 
 		 268 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  67.91 
 
 		 268 aa  358  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  68.28 
 
 		 268 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 		 278 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  67.54 
 
 		 268 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  65.67 
 
 		 269 aa  348  5e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  63.5 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  50.38 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  43.08 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.32 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  41.27 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 		 275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  42.19 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  40.17 
 
 		 277 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.04 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.76 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.51 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.51 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.5 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.67 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.22 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.12 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.05 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1132  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.39 
 
 		 269 aa  118  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.77 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.33 
 
 		 651 aa  117  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.68 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.9 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 		 262 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.56 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  32.64 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.76 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.05 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.89 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 		 245 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 		 254 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.8 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.48 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.42 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.84 
 
 		 662 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.89 
 
 		 659 aa  109  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.76 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  33.61 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.68 
 
 		 661 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.26 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.74 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>