More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0032 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  74.89 
 
 		 525 aa  723    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  100 
 
 		 464 aa  969    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  79.31 
 
 		 460 aa  785    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  59.38 
 
 		 469 aa  559  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  56.34 
 
 		 475 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  54.13 
 
 		 471 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  55.45 
 
 		 470 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  40.47 
 
 		 560 aa  340  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  42.68 
 
 		 441 aa  319  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  38.46 
 
 		 461 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  40 
 
 		 1005 aa  257  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  38.39 
 
 		 1018 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  37.53 
 
 		 988 aa  244  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  37.86 
 
 		 1046 aa  243  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  37.35 
 
 		 1024 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  36.27 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  35.17 
 
 		 1498 aa  234  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  36.76 
 
 		 1021 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  36.8 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  37.62 
 
 		 763 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  35.4 
 
 		 839 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  37.5 
 
 		 384 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  36.83 
 
 		 1029 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  34.75 
 
 		 1024 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  37.14 
 
 		 1029 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  37.07 
 
 		 1010 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  35.85 
 
 		 1024 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  35.89 
 
 		 908 aa  226  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  36.54 
 
 		 1029 aa  226  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  34.64 
 
 		 1024 aa  226  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  36.56 
 
 		 1020 aa  226  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  35.5 
 
 		 386 aa  226  8e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  35.12 
 
 		 1010 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  35.52 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  36.09 
 
 		 385 aa  217  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  35.5 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  35.18 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  34.92 
 
 		 407 aa  213  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  33.58 
 
 		 385 aa  212  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  34.63 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  32.34 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  33 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  33.82 
 
 		 396 aa  206  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  35.19 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  34.09 
 
 		 383 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  33.08 
 
 		 403 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  35.1 
 
 		 385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  32.92 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  35.37 
 
 		 403 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  34.43 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  33.94 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.39 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  31.17 
 
 		 397 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  29.66 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  34.1 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  32.33 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  31.57 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  30.71 
 
 		 384 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.92 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  32.18 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  31.89 
 
 		 420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  31.68 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  28.71 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  32.4 
 
 		 376 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  31.12 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  27.05 
 
 		 392 aa  159  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  31.12 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  31.12 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  31.12 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  31.12 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  31.12 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  31.12 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  30.87 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  30.87 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  30.69 
 
 		 373 aa  156  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  28.53 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  28.68 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  27.3 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  25.98 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  26.05 
 
 		 401 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  26.17 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  25 
 
 		 444 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  24.3 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  25.57 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  24.58 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  25.34 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  23.93 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  24.11 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  25.81 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  24.76 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  24.7 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03850  conserved hypothetical protein  33.87 
 
 		 296 aa  69.7  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  21.41 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  22.65 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  22.66 
 
 		 582 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  22.27 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  24.03 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  34.35 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  34.56 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  37.01 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>