More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1934 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1934  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1816  geranyltranstransferase  59.93 
 
 		 281 aa  336  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1635  geranyltranstransferase  59.93 
 
 		 281 aa  336  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2004  geranyltranstransferase  59.57 
 
 		 281 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0115  geranyltranstransferase  56.07 
 
 		 282 aa  325  6e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0332253  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1736  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase; FPP synthase)  57.14 
 
 		 299 aa  319  3e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0071  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  53.54 
 
 		 300 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.160722  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0337  polyprenyl synthetase  52.33 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0068  geranyltranstransferase  53.43 
 
 		 277 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.105002  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0201  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  49.3 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  37.81 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  39.1 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  40.39 
 
 		 294 aa  175  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  39.62 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  40.14 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  38.58 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  38.2 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  39.59 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  38.2 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  39.39 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  38.2 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  41.76 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  37.4 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  37.21 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  40.48 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  38.58 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  38.26 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  37.04 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  38.28 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  36.67 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  41.35 
 
 		 293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  37.92 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  37.78 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  36.84 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  42.62 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  36.52 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  37.08 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  39.16 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  38.93 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  40.8 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  37.59 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  37.59 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  37.59 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  37.59 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  37.87 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  37.02 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  43.02 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  40.95 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  39.46 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  35.82 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  38.87 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  37.63 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  41.38 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  38.82 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  37.23 
 
 		 294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1678  Polyprenyl synthetase  40.78 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.252653  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  40.52 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  37.68 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  34.59 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  39.62 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  40.89 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  40.43 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  44.39 
 
 		 305 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  40.79 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  35.84 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01426  geranyltranstransferase  42.25 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.631666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  39.62 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  40.37 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  36.97 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  38.93 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  35.48 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  40.16 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  39.13 
 
 		 299 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  38.98 
 
 		 296 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  40.18 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  39.83 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  38.72 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  39.83 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  40.38 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  40.38 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  40.38 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  40.38 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  35.82 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  35.82 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  36.52 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  40.38 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  35.82 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1707  polyprenyl synthetase  38.89 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219541  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  35.82 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  35.82 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  35.82 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  35.82 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  38.13 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  36.62 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  39.35 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  39.35 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  39 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>