More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0115 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0115  geranyltranstransferase  100 
 
 
282 aa  564  1e-160  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0332253  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1635  geranyltranstransferase  67.87 
 
 
281 aa  384  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1816  geranyltranstransferase  67.87 
 
 
281 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2004  geranyltranstransferase  67.51 
 
 
281 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1736  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase; FPP synthase)  56.9 
 
 
299 aa  332  5e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1934  Polyprenyl synthetase  56.07 
 
 
286 aa  325  6e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0071  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  53.36 
 
 
300 aa  323  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.160722  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0068  geranyltranstransferase  55.56 
 
 
277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.105002  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0201  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  54.29 
 
 
284 aa  299  3e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0337  polyprenyl synthetase  51.08 
 
 
282 aa  272  5.000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  46.26 
 
 
294 aa  186  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  36.43 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  39.64 
 
 
296 aa  171  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  38.29 
 
 
300 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.61 
 
 
297 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  39.36 
 
 
290 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  42.11 
 
 
294 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  39.36 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  37.73 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  39.03 
 
 
293 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  38.38 
 
 
295 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  42.24 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  38.29 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  41.27 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  42.67 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  42.67 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  37.9 
 
 
292 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  37.17 
 
 
295 aa  161  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  41.5 
 
 
298 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  38.15 
 
 
305 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  41.63 
 
 
299 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  36.25 
 
 
290 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  40.98 
 
 
290 aa  159  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  37.13 
 
 
295 aa  159  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  41.25 
 
 
299 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  37.89 
 
 
297 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  39.06 
 
 
294 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  38.76 
 
 
299 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  43.23 
 
 
294 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  37.75 
 
 
297 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  37.94 
 
 
294 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  37.94 
 
 
294 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  36.55 
 
 
294 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  42.48 
 
 
290 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  37.94 
 
 
294 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  37.75 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  35.74 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  37.94 
 
 
294 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  37.94 
 
 
294 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  37.55 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  39.02 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  33.33 
 
 
315 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  38 
 
 
299 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  35.61 
 
 
293 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  35.61 
 
 
293 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  37.35 
 
 
293 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  35.61 
 
 
293 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  40.09 
 
 
300 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  37.55 
 
 
294 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  35.74 
 
 
293 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  37.35 
 
 
293 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  37.59 
 
 
297 aa  149  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  39.66 
 
 
300 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  38.49 
 
 
321 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  38.65 
 
 
294 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  42.2 
 
 
293 aa  149  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  35.25 
 
 
293 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  36.11 
 
 
294 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  36.11 
 
 
294 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  36.11 
 
 
294 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  42.67 
 
 
306 aa  148  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  39.68 
 
 
294 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  36.11 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  36.11 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  36.11 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  38.49 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  36.11 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  40.93 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  38.5 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  34.4 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  41.22 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  38.49 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  36.84 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  36.25 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  36.76 
 
 
306 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  39.69 
 
 
299 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  37.65 
 
 
307 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  36.76 
 
 
306 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  36 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  35.07 
 
 
299 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  36.9 
 
 
308 aa  145  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  37.5 
 
 
337 aa  145  8.000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  37.72 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  35.6 
 
 
291 aa  145  9e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  36.55 
 
 
294 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  41.39 
 
 
296 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  40.24 
 
 
297 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  40.09 
 
 
302 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1707  polyprenyl synthetase  37.76 
 
 
303 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219541  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  42.67 
 
 
289 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>