More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0071 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0071  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  100 
 
 		 300 aa  610  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.160722  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1736  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase; FPP synthase)  72.24 
 
 		 299 aa  447  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0068  geranyltranstransferase  58.5 
 
 		 277 aa  344  1e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.105002  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0201  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  56 
 
 		 284 aa  332  7.000000000000001e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0115  geranyltranstransferase  53.36 
 
 		 282 aa  323  2e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0332253  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1635  geranyltranstransferase  52.35 
 
 		 281 aa  321  9.000000000000001e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2004  geranyltranstransferase  52.35 
 
 		 281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1816  geranyltranstransferase  52.35 
 
 		 281 aa  319  3e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1934  Polyprenyl synthetase  53.54 
 
 		 286 aa  308  8e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0337  polyprenyl synthetase  48.91 
 
 		 282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  36.57 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  39.38 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  34.68 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  39.83 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  40.07 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  34.26 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  38.4 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  40.73 
 
 		 296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  37.14 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  36.96 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  34.27 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  40.89 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  36.19 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0754  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.45 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000103665  hitchhiker  0.0000280825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  37.79 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  38.57 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  39.13 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  37.28 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  38.06 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  38.91 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  35.82 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  37.4 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  36.59 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  33.71 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  36.84 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  33.33 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  36.69 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  35.82 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  41.45 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  37.41 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  38.7 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  35.16 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  38.58 
 
 		 306 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  41.98 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  41.98 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  35.89 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  36.09 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  38.31 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  38.31 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  38.31 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  38.31 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  39.59 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  38.34 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  38.82 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  38.82 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  38.82 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  37.61 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  38.82 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  38.82 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  33.11 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  37.02 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  35.59 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  39.09 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  36.78 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  38.04 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  36.24 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  35.29 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  34.49 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  34.49 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  34.49 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  36.78 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  36.11 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  42.13 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  36.8 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  35.46 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  37.02 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1089  geranyltranstransferase  38.89 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  36.26 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  34.49 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  40.83 
 
 		 289 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  38.1 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  37.55 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  34.92 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  35.39 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  39.01 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  34.59 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  36.13 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2228  polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0274  geranyltranstransferase  39.73 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  35.86 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  35.86 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>