176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2569 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2569  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 171 aa  353  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03841  CBS domain pair, putative  49.68 
 
 		 172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.39 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2340  signal transduction protein  24.5 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  25.83 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  29.14 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  29.41 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  29.08 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.48 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  27.45 
 
 		 339 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  26.97 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  25.17 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  27.04 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  28.67 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  25.83 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  29.73 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  28.19 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.32 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  25.49 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 		 386 aa  54.7  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  27.85 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.43 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 		 242 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.15 
 
 		 338 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  26.97 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  30.72 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  28.95 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  26.17 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  24.68 
 
 		 258 aa  52.4  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.44 
 
 		 620 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1696  CBS domain-containing protein  23.84 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000358324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  25.83 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.81 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  25.33 
 
 		 378 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  29.87 
 
 		 236 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  24.68 
 
 		 300 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  27.5 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  22.67 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  25.64 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  22.73 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36397  predicted protein  24.5 
 
 		 759 aa  49.3  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  26.62 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  24.52 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2358  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.42 
 
 		 494 aa  48.5  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.890412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  25.81 
 
 		 413 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  25.17 
 
 		 242 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  27.08 
 
 		 292 aa  48.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  25.15 
 
 		 348 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  34.15 
 
 		 330 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  24.67 
 
 		 132 aa  48.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  24.34 
 
 		 127 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  22.08 
 
 		 223 aa  48.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.49 
 
 		 495 aa  48.1  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.757104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  29.3 
 
 		 133 aa  47.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  25.97 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  25.2 
 
 		 226 aa  47.4  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  23.9 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  26.14 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  23.84 
 
 		 339 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  28.85 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  25 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  27.1 
 
 		 413 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  24.49 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  25.66 
 
 		 281 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  23.81 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  31.09 
 
 		 332 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  26.75 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.63 
 
 		 628 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  26.97 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  24.84 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  26.42 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  24.84 
 
 		 427 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  25.49 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  23.53 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2230  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.24818  normal  0.0199639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  26 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  25.62 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  21.71 
 
 		 320 aa  45.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  22.15 
 
 		 124 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  23.42 
 
 		 427 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  28 
 
 		 231 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  24.14 
 
 		 120 aa  45.1  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  26.83 
 
 		 688 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  26.42 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  23.18 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  26.17 
 
 		 490 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 279 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  22.15 
 
 		 258 aa  44.7  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 		 391 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  26.75 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  23.65 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>