204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1042 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 565 aa  1157    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  50.09 
 
 		 574 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  41.92 
 
 		 581 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  41.57 
 
 		 589 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  41.74 
 
 		 589 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  40.6 
 
 		 576 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  39.82 
 
 		 596 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  34.31 
 
 		 596 aa  372  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  37.04 
 
 		 595 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  33.28 
 
 		 596 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  33.1 
 
 		 604 aa  319  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 		 598 aa  317  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  29.78 
 
 		 599 aa  278  1e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  26.92 
 
 		 545 aa  190  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  26.92 
 
 		 545 aa  190  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 589 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  25.13 
 
 		 593 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  23.83 
 
 		 592 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  27.26 
 
 		 610 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  25.44 
 
 		 641 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  32.48 
 
 		 248 aa  115  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  38.14 
 
 		 218 aa  113  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  25.37 
 
 		 578 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  34.34 
 
 		 247 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  24.63 
 
 		 606 aa  100  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  37.43 
 
 		 229 aa  100  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  30.43 
 
 		 239 aa  99.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  24.4 
 
 		 587 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  23.26 
 
 		 605 aa  94  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 602 aa  94  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  22.89 
 
 		 617 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  35.67 
 
 		 212 aa  89.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  24.23 
 
 		 576 aa  87  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  25.27 
 
 		 594 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  28.08 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  23.99 
 
 		 589 aa  84  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  24.18 
 
 		 615 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  21.92 
 
 		 619 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  25.41 
 
 		 612 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  30.46 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  26.61 
 
 		 599 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 		 616 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  29.27 
 
 		 602 aa  73.9  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  21.3 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  27.5 
 
 		 245 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  26.2 
 
 		 611 aa  66.6  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  23.1 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  23.03 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  22.96 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  27.59 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  24.56 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  21.56 
 
 		 618 aa  63.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  27.32 
 
 		 602 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  29.07 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  27.4 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  23.1 
 
 		 741 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  32 
 
 		 858 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  32 
 
 		 930 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  22.59 
 
 		 360 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  32 
 
 		 896 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  25.98 
 
 		 1017 aa  56.2  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  22.9 
 
 		 741 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  33.93 
 
 		 1057 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  32 
 
 		 872 aa  54.7  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4348  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  54.7  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0387743  normal  0.103118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  22.18 
 
 		 652 aa  53.5  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  28.66 
 
 		 697 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 792 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  34.31 
 
 		 633 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  24.23 
 
 		 706 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  26.15 
 
 		 275 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  32.14 
 
 		 1048 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  23.33 
 
 		 1095 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  30.53 
 
 		 702 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 748 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 633 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  30.53 
 
 		 702 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 748 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 748 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 748 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  27.75 
 
 		 641 aa  51.2  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 633 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 633 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3430  putative VGR-related protein  22.35 
 
 		 921 aa  50.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  25.94 
 
 		 706 aa  50.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  25.44 
 
 		 694 aa  50.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1111 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  26.48 
 
 		 1111 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  23.79 
 
 		 782 aa  50.4  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  25.14 
 
 		 193 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  30.47 
 
 		 754 aa  50.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1876  hypothetical protein  23.78 
 
 		 349 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  22.01 
 
 		 341 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  26.48 
 
 		 1111 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  25.14 
 
 		 754 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  25.55 
 
 		 1111 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  29.77 
 
 		 713 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  25.11 
 
 		 687 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  25.11 
 
 		 687 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  25.11 
 
 		 687 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>