247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0748 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0748  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  41.74 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1658  putative polysaccharide biosynthesis protein  41.1 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653687  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.38 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  35.05 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.29 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  35.94 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.52 
 
 		 282 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  35.08 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  29.86 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  34.03 
 
 		 294 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  30 
 
 		 295 aa  98.2  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  26.29 
 
 		 306 aa  96.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  34.91 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 299 aa  92.8  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 		 305 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.01 
 
 		 298 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  29.69 
 
 		 392 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  33.75 
 
 		 332 aa  86.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  32.5 
 
 		 297 aa  86.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  30.3 
 
 		 335 aa  85.1  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  29.82 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  37.3 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  29.76 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  30.57 
 
 		 330 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  30.41 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  32.77 
 
 		 684 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 804 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  28.43 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  30.57 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  29.5 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  30.93 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  31.18 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  30.93 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.63 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  28.72 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  28.72 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 		 288 aa  71.6  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  29.34 
 
 		 803 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  29.09 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  28.72 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  31.52 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1010  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.34 
 
 		 599 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.69 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  26.44 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  29.7 
 
 		 803 aa  69.3  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4516  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.23 
 
 		 740 aa  69.3  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  30.77 
 
 		 790 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  28.64 
 
 		 739 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  28.64 
 
 		 739 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  28.64 
 
 		 739 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  27.84 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  29.44 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  25.14 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  30 
 
 		 496 aa  65.1  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.64 
 
 		 739 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  30.41 
 
 		 790 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  28.36 
 
 		 751 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.28 
 
 		 575 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  29.01 
 
 		 814 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  28.98 
 
 		 759 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  26.94 
 
 		 721 aa  62.4  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  28.57 
 
 		 744 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  28.5 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.78 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  30.23 
 
 		 722 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 		 730 aa  61.6  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  26.29 
 
 		 776 aa  62  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  26.67 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  25.77 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  28.21 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  30.49 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  27.68 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  27.07 
 
 		 719 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  27.6 
 
 		 756 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  26.14 
 
 		 767 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  25.39 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  26.67 
 
 		 784 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  28.21 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  28.57 
 
 		 741 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  26.67 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  26.15 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  30.65 
 
 		 756 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  25.55 
 
 		 719 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  27.5 
 
 		 795 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  25.55 
 
 		 719 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  25.55 
 
 		 719 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  25.55 
 
 		 719 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  30.06 
 
 		 741 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  31.14 
 
 		 741 aa  59.3  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  25.64 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.67 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.67 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  27.84 
 
 		 753 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1420  capsular exopolysaccharide family  31.61 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  26.92 
 
 		 744 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  29.19 
 
 		 667 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.12 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>