More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0111 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4429  acriflavin resistance protein  98.87 
 
 		 1059 aa  2108    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4289  acriflavin resistance protein  97.73 
 
 		 1055 aa  2012    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2405  acriflavin resistance protein  53.51 
 
 		 1051 aa  1102    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0111  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1059 aa  2130    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0104  acriflavin resistance protein  89.3 
 
 		 1056 aa  1853    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  34.71 
 
 		 1092 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6349  acriflavin resistance protein  34.83 
 
 		 1064 aa  585  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0835  acriflavin resistance protein  34.55 
 
 		 1042 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181435  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0917  acriflavin resistance protein  34.58 
 
 		 1054 aa  534  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1961  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.52 
 
 		 1038 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4375  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1038 aa  489  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000150121  normal  0.679218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4767  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1037 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300742  unclonable  0.0000000523741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0140  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1026 aa  486  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2667  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.21 
 
 		 1035 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0044  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1036 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3430  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1037 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1475  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1027 aa  453  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.521845  normal  0.0685081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3726  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 		 1061 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.226552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3672  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1061 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1050 aa  354  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1023 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1083 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.16 
 
 		 1044 aa  321  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.29 
 
 		 1043 aa  319  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1044 aa  317  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1085 aa  317  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1085 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1085 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1085 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  24.55 
 
 		 1011 aa  313  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1017 aa  311  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 		 1087 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3737  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1014 aa  307  8.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.89 
 
 		 1031 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.72 
 
 		 1081 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1083 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1031 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  25.89 
 
 		 1031 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  25.89 
 
 		 1031 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1031 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.92 
 
 		 1034 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1031 aa  304  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1024 aa  303  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1102 aa  303  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.35 
 
 		 1031 aa  303  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1031 aa  302  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1087 aa  301  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.17 
 
 		 1049 aa  301  4e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1058 aa  301  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  25.21 
 
 		 1041 aa  301  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1040 aa  301  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.21 
 
 		 1031 aa  301  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1087 aa  301  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1029 aa  299  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 		 1034 aa  299  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1030 aa  300  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1087 aa  299  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.2 
 
 		 1091 aa  298  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1058 aa  296  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 		 1031 aa  296  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1040 aa  295  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1027 aa  295  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  23.72 
 
 		 1068 aa  295  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  25.35 
 
 		 1042 aa  295  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1034 aa  293  9e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1037 aa  293  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 		 1027 aa  293  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1042 aa  292  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  24.91 
 
 		 1038 aa  291  3e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1034 aa  291  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1028 aa  290  9e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  24.77 
 
 		 1031 aa  290  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  23.27 
 
 		 1040 aa  287  9e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1060 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1040 aa  286  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1028 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  25.95 
 
 		 1035 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  23.6 
 
 		 1034 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  23.79 
 
 		 1036 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.21 
 
 		 1024 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  24.91 
 
 		 1092 aa  283  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1069 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.03 
 
 		 1024 aa  281  6e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  24.19 
 
 		 1059 aa  281  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  23.71 
 
 		 1046 aa  279  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  25.37 
 
 		 1039 aa  278  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01699  RND family efflux transporter  25.23 
 
 		 1038 aa  277  9e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1036 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  24.43 
 
 		 1065 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1121  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  25.74 
 
 		 1044 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  23.46 
 
 		 1031 aa  275  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 		 1031 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1050 aa  275  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  24.26 
 
 		 1014 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  25.58 
 
 		 1044 aa  274  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1037 aa  274  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  23.22 
 
 		 1071 aa  273  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  23.58 
 
 		 1058 aa  273  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  24.53 
 
 		 1035 aa  273  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1044 aa  273  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>