More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2806 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2806  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 273 aa  540  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  98.53 
 
 		 273 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  98.17 
 
 		 273 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1659  tryptophan synthase subunit alpha  94.96 
 
 		 278 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681458  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  93.17 
 
 		 278 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  87.05 
 
 		 278 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  87.77 
 
 		 278 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  90.91 
 
 		 278 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1523  tryptophan synthase subunit alpha  86.69 
 
 		 278 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  78.81 
 
 		 272 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1585  tryptophan synthase subunit alpha  80.68 
 
 		 269 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  80.45 
 
 		 267 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2256  tryptophan synthase subunit alpha  78.2 
 
 		 267 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1681  tryptophan synthase subunit alpha  77.7 
 
 		 272 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  74.19 
 
 		 281 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  67.42 
 
 		 269 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  74.24 
 
 		 266 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  65.15 
 
 		 268 aa  356  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  65.15 
 
 		 269 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  70.08 
 
 		 268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 268 aa  350  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 268 aa  344  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  68.3 
 
 		 268 aa  344  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 268 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  64.02 
 
 		 268 aa  340  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  63.64 
 
 		 268 aa  338  4e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  63.26 
 
 		 270 aa  337  9e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  65.53 
 
 		 269 aa  335  5e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 268 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 268 aa  334  7e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  65.15 
 
 		 268 aa  334  7e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  65.15 
 
 		 268 aa  334  7e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 268 aa  334  7e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 268 aa  334  7e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 268 aa  334  7e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  64.77 
 
 		 268 aa  333  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  63.64 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1937  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.66163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2047  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2317  tryptophan synthase subunit alpha  62.55 
 
 		 271 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  58.15 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02293  tryptophan synthase subunit alpha  56.37 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  53.56 
 
 		 280 aa  259  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 274 aa  191  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  40.87 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 280 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  40.68 
 
 		 271 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  36.88 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 278 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  37.26 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.3 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  41 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 271 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  38.31 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  36.14 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  37.64 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  40.53 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  39.76 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  37.55 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  38.06 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  38 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  40.68 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 278 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  39.03 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  39.08 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  39.51 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  36.55 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  39.33 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  37.07 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  35.36 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  42.97 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  38.91 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  34.59 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  36.09 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  34.6 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  38.95 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  38.15 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.33 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  38.68 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  35.58 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  35.63 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>