More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3695 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 445 aa  906    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  59.64 
 
 		 441 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  49.31 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  47.41 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  47.03 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  44.8 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  45.68 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  47.59 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  46.5 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  46.59 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  46.68 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  46.26 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  47.18 
 
 		 441 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 		 441 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  45.58 
 
 		 441 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  46.51 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 		 441 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 		 441 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  46.48 
 
 		 441 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  45.58 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 441 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  45.58 
 
 		 466 aa  349  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  44.42 
 
 		 441 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  40.87 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  39.5 
 
 		 442 aa  332  9e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 		 444 aa  312  9e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  39.28 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  40.65 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  38.99 
 
 		 443 aa  293  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  38.25 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  38.79 
 
 		 447 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  36.28 
 
 		 430 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  37.67 
 
 		 431 aa  273  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 447 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 431 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  33.41 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 442 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  34.54 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  34.54 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  34.54 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  34.39 
 
 		 442 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  34.57 
 
 		 436 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 446 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 428 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 423 aa  206  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 390 aa  137  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 382 aa  123  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 381 aa  117  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.94 
 
 		 386 aa  113  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.11 
 
 		 384 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 378 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 386 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 500 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 392 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 385 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 383 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 496 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 395 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>