53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2804 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2804  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  362  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000371866  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  22.66 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  21.62 
 
 		 148 aa  48.5  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 167 aa  45.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  20.98 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  20.19 
 
 		 150 aa  45.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 146 aa  44.7  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  28.46 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  25.26 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  31.36 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 167 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 157 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  26.14 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 142 aa  41.6  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0933  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 150 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 149 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  19.69 
 
 		 156 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>