More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1588 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  777    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 447 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 445 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 447 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  32.45 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  34.72 
 
 		 446 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  33.83 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  33.83 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  33.83 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  33.83 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.83 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.83 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  33.58 
 
 		 451 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 446 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  32.43 
 
 		 579 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  29.78 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  32.17 
 
 		 458 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 448 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 438 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  31.8 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 453 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  35.45 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 449 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 449 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  32.14 
 
 		 451 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  34.9 
 
 		 455 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  31.89 
 
 		 454 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 454 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3530  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  33.25 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  31.12 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  30.56 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  32.77 
 
 		 452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 457 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  31.81 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  31.28 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  32.54 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.57 
 
 		 465 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 453 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 453 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 449 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  29.88 
 
 		 475 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 447 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  29.63 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  35.7 
 
 		 487 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 451 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  31.55 
 
 		 448 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  31.63 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  29.63 
 
 		 448 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 447 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 452 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 453 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 449 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 468 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  29.38 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  30.08 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  28.61 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  31.92 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.1 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 460 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3217  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  34.5 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636967  normal  0.114002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  30.34 
 
 		 447 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  30 
 
 		 458 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 458 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  34.01 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 452 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  31.26 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.43 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  30 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  31.7 
 
 		 450 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>