96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1557 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  60.24 
 
 		 257 aa  315  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  56.5 
 
 		 255 aa  291  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  32.91 
 
 		 241 aa  128  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  30 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  30.98 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6484  regulatory protein, IclR  27.94 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476341  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3621  regulatory protein, IclR  28.14 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  27.18 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  30.27 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  28.07 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  27.4 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  26.6 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  23.32 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  25.61 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  24.1 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  28.57 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  27.13 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  23.04 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  24.5 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  24.39 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  25.33 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  24.71 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  21.24 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  21.43 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  22.93 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  20.6 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  25.11 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2707  regulatory protein IclR  24.75 
 
 		 292 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0264  transcriptional regulator, IclR family  21.62 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  21.61 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  24.43 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  20.76 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  26.56 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  20.27 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  26.02 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  21.43 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  22.47 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  21.51 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  23.89 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5102  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500204  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  25.35 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  20.63 
 
 		 249 aa  45.4  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2967  IclR family transcriptional regulator  19.34 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2835  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00508423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  22.77 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  35.29 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  22.22 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  26.62 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  18.78 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  23.65 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  23.11 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  22.17 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  23.23 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  27.74 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  23.23 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  22.08 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  22.46 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  24.23 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  24.23 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  20.27 
 
 		 270 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 262 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>