120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3621 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3621  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 268 aa  549  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  28.14 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  26.67 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  25.55 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  28.08 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  26.55 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  26.92 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  25.88 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  25.83 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  28.39 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  24.43 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  20.72 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1960  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.124593  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  24.29 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  23.89 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6484  regulatory protein, IclR  29.9 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476341  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  32.76 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  32.32 
 
 		 336 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 283 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  29.91 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  25.44 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  21.24 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  34.95 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  24.1 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  31.96 
 
 		 254 aa  49.7  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  21.67 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  25.24 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  22.03 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  39.66 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  22.27 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  22.95 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  23.79 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  21.82 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  20.09 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  27.09 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  18.75 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  24.44 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0607  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171658  normal  0.119354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  28.21 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  20.28 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  24.87 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  25.88 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  25.38 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  35.45 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  28.15 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  19.81 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  24.35 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  24.51 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  19.35 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.19 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.19 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  24.42 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  26.19 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  26.19 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  33.82 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.19 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.19 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3389  transcriptional regulator, IclR family, C-terminal domain  23.53 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  26.19 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.19 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3158  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  40.82 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.797514 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  26.98 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>